研究発表 - 泰岡 顕治
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FMO計算に基づくマルチスケールシミュレーションのナノバイオ系への応用
奥脇 弘次, 土居 英男, 望月 祐志, 小沢 拓, 泰岡 顕治, 福澤 薫
第65回応用物理学会春期学術講演会 （東京） ,
2018年03月,口頭発表（一般）
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FMO計算に基づくマルチスケールシミュレーション環境の構築
奥脇 弘次, 土居 英男, 望月 祐志, 小沢 拓, 泰岡 顕治, 福澤 薫
2017年度 高分子基礎物性研究会・高分子計算機科学研究会 合同討論会 （東京） ,
2018年03月,口頭発表（一般）
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高分子ダイナミクスの普遍性を応用した分子シミュレーションの階層間接続
高橋和義，西村龍斗，大和伸好，泰岡顕治，増渕雄一
第31回分子シミュレーション討論会,
2017年11月,ポスター発表, 石川
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FDPS を用いた水の分子動力学シミュレーション
野村 昴太郎 ，岩澤全規，行方大輔，野澤拓磨，泰岡顕治，牧野淳一郎
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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固体表面における水滴の衝突及び跳ね返り条件
古石貴裕，泰岡顕治，Xiao C. Zeng
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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FDPS を用いた水の分子動力学シミュレーション
野村 昴太郎 ，岩澤全規，行方大輔，野澤拓磨，泰岡顕治，牧野淳一郎
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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大規模分子動力学法を用いた低過飽和度条件における液滴均一核生成の自由エネルギー解析
阿由葉翔, 野村昴太郎, 徐東郁, 泰岡顕治
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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二酸化炭素ハイドレートの分解過程における分子動力学シミュレーション
長谷川智大，湯原大輔，Paul E. Brumby，泰岡顕治
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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ヘマグルチニンとGM3分子間のリガンドー受容体相互作用の解析 その2
九十九慶之, 山本詠士, 井上堅斗, 泰岡顕治, 三上益弘
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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レプリカ交換分子動力学シミュレーションによるナノスリット内の氷/水相平衡及び相転移の解析
山光隆一, 野村昴太郎, 泰岡顕治
第31回分子シミュレーション討論会 （石川） ,
2017年11月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation on Thermal Fluctuation of Seed Particle Heterogeneous Bubble Nucleation
Suh, D., Yasuoka, K.
The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference (TFEC9) （Okinawa, Japan） ,
2017年10月,口頭発表（一般）
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Replica Exchange Monte Carlo Simulations of Frustrated Chiral Liquid-Crystal Phases
Nozawa, T., Brumby, P. E., Yasuoka, K.
The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference (TFEC9) （Okinawa, Japan） ,
2017年10月,口頭発表（一般）
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Comparison and linkage of static and dynamic polymer properties between atomistic model of polymers and bead-spring model
Takahashi, K. Z., Nishimura, R., Yamato, N., Yasuoka, K., Masubuchi, Y.
The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference (TFEC9) （Okinawa, Japan） ,
2017年10月,口頭発表（一般）
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Structural Order of Water molecules on Modified Surfaces
Imai, N., Suh, D., Yasuoka, K.
The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference (TFEC9) （Okinawa, Japan） ,
2017年10月,口頭発表（一般）
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Guest-host interaction and stability of TBAB semiclathrate hydrates by ab initio calculations
Hiratsuka, M., Ohmura, R., Yasuoka, K.
The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference (TFEC9) （Okinawa, Japan） ,
2017年10月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of Rhodopsin and Opsin: Water transport through internal water pathways
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K., Yasuoka, K.
Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences (MSSMBS) 2017 （St. Petersburg, Russia） ,
2017年09月,口頭発表（一般）
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A study on frustrated chiral liquid-crystal phases with large pitch distances by molecular simulations
Nozawa, T. Brumby,P. E., Yasuoka, K.
Thermodynamics 2017 （Edinburgh, UK） ,
2017年09月,口頭発表（一般）
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The Frank twist elastic constant of an achiral liquid-crystal fluid from orientational perturbations
Brumby, P. E., Nozawa, T., Schoen, M., Haslam, A., Jackson, G., Yasuoka, K.
Thermodynamics 2017 （Edinburgh, UK） ,
2017年09月,ポスター発表
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FMO計算に基づくマルチスケールシミュレーション手法の開発と先導的応用
奥脇 弘次, 土居 英男, 望月 祐志, 小沢 拓, 泰岡 顕治
第11回分子科学討論会 （仙台） ,
2017年09月,口頭発表（一般）
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FMO 計算に基づくマルチスケールシミュレーション手法の開発と先導的応用
奥脇 弘次, 土居 英男, 望月 祐志, 小沢 拓, 泰岡 顕治
第15回未踏科学サマー道場 （神奈川） ,
2017年09月,口頭発表（一般）
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TBABを含むセミクラスレートハイドレートの分子動力学計算
平塚将起，大村亮，泰岡顕治
日本エネルギー学会第26回大会 （愛知） ,
2017年08月,口頭発表（一般）
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分子シミュレーションを用いたメタンハイドレートの相平衡条件及びケージ占有率の解析
湯原大輔，Paul E. Brumby, David T. Wu, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
日本エネルギー学会第26回大会 （愛知） ,
2017年08月,口頭発表（一般）
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Simulations of Gas Hydrates by the Gibbs Ensemble Monte Carlo Method with Partial Phase Separation
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D., Sum, A. K., Yasuoka, K.
The 9th International Conference on Gas Hydrates （Denver, CO, USA） ,
2017年07月,ポスター発表
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Kinetic analysis of homogeneous droplet nucleation using large scale molecular dynamics simulation
Ayuba, S., Nomura, K., Suh, D. and Yasuoka, K.
The 20th International Chemical on Nucleation and Atmospheric Aerosols （Helsinki, Finland） ,
2017年07月,ポスター発表
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Analysis of Three Phase Co-Existence Conditions for Methane Hydrate, Methane Vapor, and Liquid Water System using Isothermal-Isometric Molecular Dynamics Simulation
Yuhara, D., Brumby, P. E., Wu, D., Sum, A. K., Yasuoka, K.
The 9th International Conference on Gas Hydrate （Denver, CO, USA） ,
2017年07月,ポスター発表
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"Isothermal-isobaric Gibbs ensemble Monte Carlo simulations of various clathrate hydrates"
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D., Sum, A. K., Yasuoka, K.
Clathrate Hydrates Fundamentals Workshop （Telluride, CO, USA） ,
2017年07月,口頭発表（一般）
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Isometric-Isothermal Molecular Dynamics Simulation of Methane Hydrate/Water/Methane Coexistence System
Daisuke Y., Brumby, P. E., Wu, D., Sum, A. K., Yasuoka, K.
Clathrate Hydrate Fundamentals Workshop （Telluride, CO, USA） ,
2017年07月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulations for the dissociation process of carbon dioxide hydrate
Hasegawa, T., Yuhara, D., Brumby, P. E., Ohmura, R., Yasuoka, K.
Clathrate Hydrates Fundamentals Workshop, 2017 （Telluride, CO, USA） ,
2017年07月,口頭発表（一般）
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Monte Carlo studies on the phase behaivior of model chiral liquid-crystals using the hybrid achoring approach
Nozawa, T., Brumby, P. E., Yasuoka, K.
10th Liquid Matter Conference （Ljubljana, Slovenia） ,
2017年07月,ポスター発表
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FMO 計算に基づくマルチスケールシミュレーション手法の開発と先導的応用
奥脇 弘次, 土居 英男, 望月 祐志, 小沢 拓, 泰岡 顕治
第20回理論化学討論会 （京都） ,
2017年05月,ポスター発表
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Understanding heterogeneous nucleation on various precursor configurations by molecular dynamics
Suh, D., and Yasuoka, K.
The 6th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-6) （Fukuoka, Japan） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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Development of a force field of TiO2-water interactions for classical molecular simulation by density functional theory
Irie, M., Morita, K., and Yasuoka, K.
The 6th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-6) （Fukuoka, Japan） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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Behavior of excess electrons introduced by Ti interstitial in rutile TiO2(110) surface
Morita, K., Shibuya, T., and Yasuoka, K.
The 6th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-6) （Fukuoka, Japan） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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Replica exchange molecular dynamics simulations of quasi-two-dimensional water in nanopore slits
Yamamitsu, R., Nomura, K., and Yasuoka, K.
The 6th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-6) （Fukuoka, Japan） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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フラグメント分子軌道計算に基づく非経験的パラメータを用いた生体膜の粗視化シミュレーション
土居英男, 奥脇弘次, 望月祐志, 小沢拓, 泰岡顕治
日本化学会 第97春期年会(2017) （慶應義塾大学日吉キャンパス） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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フラグメント分子軌道計算に基づく高分子粗視化シミュレーションパラメータの算定
奥脇弘次, 川田修太郎, 望月祐志, 小沢拓, 土居英男, 泰岡顕治
日本化学会 第97春期年会(2017) （慶應義塾大学日吉キャンパス） ,
2017年03月,口頭発表（一般）
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Dissipative Particle Dynamics Simulations for Lipid Membrane using Fragment molecular orbital-based Effective Parameters
Doi, H., Okuwaki, K., Mochizuki, Y., Ozawa, T., and Yasuoka, K.
The 11th SPSJ International Polymer Conference(IPC2016) （Fukuoka, Japan） ,
2016年12月,ポスター発表
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Fragment Molecular Orbital-based Parameterizing Procedure for Dissipative Partcile Dynamics Simulations
Okuwaki, K., Doi, H., Mochizuki, Y., Ozawa, T., and Yasuoka, K.
The 11th SPSJ International Polymer Conference(IPC2016) （Fukuoka, Japan） ,
2016年12月,ポスター発表
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フラグメント分子軌道計算に基づく粗視化シミュレーションの有効パラメータ算定の展開
奥脇弘次, 望月祐志, 小沢拓, 土居英男, 泰岡顕治
2016年度 高分子基礎物性研究会・高分子計算機科学学会・高分子ナノテクノロジー研究会 合同討論会 （東京農工大学 小金井キャンパス） ,
2016年12月,口頭発表（一般）
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表在性膜タンパク質の脂質膜上での不均一拡散
山本詠士, 秋本琢磨, Antreas C. Kalli, Mark S. P. Sansom, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,口頭発表（一般）
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非調和振動ポテンシャルを用いた赤外線領域における D-グルコース水溶液内水分子の振動解析
中村真二郎, 友部勝文, 山本詠士, 石山達也, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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分子シミュレーションを用いたメタンハイドレートの相平衡条件予測方法
湯原大輔, Brumby P. E., Wu D. T., Sum, A. K., 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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活性化および非活性化ロドプシンの内部結合水の比較の分子シミュレーション
友部勝文, 山本詠士, Kholmirzo Kholmurodov, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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ヘマグルチニンとGM3分子間のリガンドー受容体相互作用の解析
九十九慶之, 山本詠士, 井上堅斗, 泰岡顕治, 三上益弘
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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分子動力学計算を用いた界面における氷 Ih の安定性に関する研究
今井尚子, 徐東郁, 高岩大輔, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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分子動力学法を用いたアルカンの均一液滴核生成の解析
阿由葉翔, 徐東郁, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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レプリカ交換分子動力学法を用いたナノスリット細孔内の氷/水相平衡シミュレーション
山光隆一, 野村昴太郎, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年12月,ポスター発表
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水-メタノール液滴に対する凹凸構造のある表面の濡れ性
古石貴裕, 泰岡顕治, X. C. Zeng
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年11月,ポスター発表
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密度汎関数理論によるルチル型 TiO2(110)表面における格子間チタン由来の余剰電子に関する研究
森田一軌, 澁谷泰蔵, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年11月,ポスター発表
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第一原理計算を用いた水素ハイドレートの振動解析
山田基, 平塚将起, David T. Wu, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年11月,ポスター発表
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分子動力学法を用いた不均一気泡核生成
徐東郁, 泰岡顕治
第30回分子シミュレーション討論会 （大阪大学） ,
2016年11月,ポスター発表
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表在性膜タンパク質の脂質膜上での異常拡散
山本詠士, 秋本琢磨, Antreas C. Kalli, Mark S. P. Sansom, 泰岡顕治
第37回日本熱物性シンポジウム （岡山国際交流センター，岡山） ,
2016年11月,口頭発表（一般）
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Vibrational spectra of water molecules in monosaccharide solutions by Car-Parinello molecular dynamics simulation
Tomobe, K., Iijima, T., Yamamoto, E., Kojic, D., Tsenkova, R., Yasui, M., and Yasuoka, K.
Aquaphotomics: Understanding Water in Biology 2nd International Symposium （Kobe, Japan） ,
2016年11月,ポスター発表
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Vibrational spectra analysis of alpha-D-glucose solution in infrared region using anharmonic potential
Nakamura, S., Tomobe, K., Yamamoto, E., Ishiyama, T., and Yasuoka, K.
Aquaphotomics: Understanding Water in Biology 2nd International Symposium （Kobe, Japan） ,
2016年11月,ポスター発表
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Investigating interactions and dynamics of pleckstrin homology domains on a lipid membrane surface
Yamamoto, E., Kalli. A. C., Akimoto, T., Sansom, M. S. P., and Yasuoka, K.
第54回生物物理学会年会 （つくば国際会議場，茨城） ,
2016年11月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation of Droplet, Bubble, and Crystal Nucleation
Suh, D. and Yasuoka, K.
The Fourth International Forum on Heat Transfer (IFHT2016) （Sendai, Japan） ,
2016年11月,口頭発表（一般）
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Understanding homogeneous nucleation by molecular dynamics
Suh, D., Nakamura, M., and Yasuoka, K.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,口頭発表（招待・特別）
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Self-assembly and layer transition of onion-like vesicles from minimal molecules
Arai, N., Yasuoka, K., and Zeng, X. C.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Heterogeneous nucleation of droplets, bubbles, and crystals by molecular dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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The stability of binary ethane-methane clathrate hydrate for various gas phase compositions by isobaric-isothermal Gibbs Ensemble Monte Carlo
Brumby, P., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Dynamics of monosaccharide and water molecule in aqueous solution: Dependence on temperature and concentration
Tomobe, K., Iijima, T., Yamamoto, E., Kojic, R. Tsenkova, D., Yasui, M., and Yasuoka, K.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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A method to detect large fluctuations of diffusivity using single-particle trajectories
Akimoto, T., Yamamoto, E., Kalli, A. C., Yasuoka, K., and Sansom M. S. P.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Replica exchange dissipative particle dynamics method on theadlike miceller aqueous solutions
Kobayashi, Y., Nomura, K., Yasuoka, K., and Arai, N.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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Molecular dynamics simulation of a bouncing droplets on a solid surface
Koishi, T., Yasuoka, K., and Zeng, X. C.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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Multdimensional replica-exchange molecular dynamics simulation of freezing behavior in quasi-one-dimensional confined water
Nomura, K., Bai, J., Yasuoka, K., and Zeng, X. C.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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Ab initio molecular dynamics simulation for the tert-n-butylammonium bromide semiclathrate hydrate
Hiratsuka, M., Ohmura, R., and Yasuoka, K.
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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Equilibrium Molecular Dynamics Simulation of Three-Phase Coexistence System for Methane Hydrate
Yuhara, D., Brumby, P. E., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.,
The 4th International Conference on Molecular Simulation(ICMS 2016) （Shanghai, China） ,
2016年10月,ポスター発表
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イオン性分子を含むクラスレート水和物の分子動力学シミュレーション
平塚 将起, 大村亮, 泰岡顕治
日本機械学会熱工学コンファレンス2016 （愛媛大学城北キャンパス，愛媛） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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単糖水和殻中の水分子の構造とダイナミクス
友部勝文, 飯島崇, 山本詠士, Dusan Kojic, Roumiana Tsenkova, 安井正人, 泰岡顕治
日本機械学会熱工学コンファレンス2016 （愛媛大学城北キャンパス，愛媛） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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NVT分子動力学シミュレーションを用いたメタンハイドレート/水/メタン系における三相平衡点の解析
湯原大輔, Brumby, P. E., Wu, D. T., Sum A. K., 泰岡顕治
日本機械学会熱工学コンファレンス2016 （愛媛大学城北キャンパス，愛媛） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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全反射ラマンイメージングによる固液界面極近傍における親水性・疎水性の分子挙動への影響の評価
木下晴貴, 木下正治, 湯原大輔, 山本憲, 泰岡顕治, 佐藤洋平, 菱田公一
日本機械学会熱工学コンファレンス2016 （愛媛大学城北キャンパス，愛媛） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Gibbs Ensemble Monte Carlo simulations of ethane-methane hydrate
Brumby, P., Yuhara, D. Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
The 11th Asian Thermophysical Properties Conference(ATPC 2016) （Yokohama, Japan） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Effect of anisotropic interactions on the phase behavior of chiral Gay-Berne systems
Nozawa, T., Brumby, P., and Yasuoka, K.
The 11th Asian Thermophysical Properties Conference(ATPC 2016) （Yokohama, Japan） ,
2016年10月,ポスター発表
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Thermal Fluctuation Analysis of Heterogeneous Bubble Nucleation by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
The 11th Asian Thermophysical Properties Conference(ATPC 2016) （Yokohama, Japan） ,
2016年10月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of Rhodopsin and Opsin: transport through internal water pathways
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov. K., and Yasuoka, K.
Khujand Symposium on Computational Materials and Biological Sciences(KSCMBS) （Khujand, Tajikistan） ,
2016年09月,口頭発表（一般）
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Vibrational spectra analysis of water molecules in infrared region using anharmonic potential
Nakamura, S., Tomobe, K., Yamamoto, E. Ishiyama, T, and Yasuoka, K.
Khujand Symposium on Computational Materials and Biological Sciences(KSCMBS) （Khujand, Tajikistan） ,
2016年09月,口頭発表（一般）
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Coarse-grained simulations to investigate the phase behavior of chiral liquid crystals
Nozawa, T., Brumby, P., and Yasuoka, K.
Khujand Symposium on Computational Materials and Biological Sciences(KSCMBS) （Khujand, Tajikistan） ,
2016年09月,口頭発表（一般）
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A linkage of static and dynamic polymer properties between atomistic and bead-spring model
Takahashi, K. Z., Nishimura, R., Yasuoka, K., and Masubuchi, Y.
6th EuCheMS Chemistry Congress （Seville, Spain） ,
2016年09月,ポスター発表
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フラグメント分子軌道計算に基づく粗視化シミュレーションの有効パラメータ算定の展開
奥脇弘次, 望月祐志, 小沢拓, 大畠広介, 土居英男, 石川雄太郎, 川田修太郎, 泰岡顕治
第77回応用物理学会秋期学術講演会 （朱鷺メッセ，新潟） ,
2016年09月,口頭発表（一般）
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フラグメント分子軌道計算に基づく有効パラメータを用いる脂質膜の粗視化シミュレーション
土居英男, 奥脇弘次, 望月祐志, 小沢拓, 泰岡顕治
第77回応用物理学会秋期学術講演会 （朱鷺メッセ，新潟） ,
2016年09月,口頭発表（一般）
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Designing of Ice Crystal Nucleation Promoting Surface Using Molecular Dynamics
Imai, N., Suh, D., Takaiwa, D., and Yasuoka, K.
The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy(ICCGE-18) （Nagoya, Japan） ,
2016年08月,ポスター発表
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Heterogeneous Crystal Growth on Seed Particle by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
The 18th International Conference on Crystal Growth and Epitaxy(ICCGE-18) （Nagoya, Japan） ,
2016年08月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation of Heterogeneous Nucleation of Aerosols from Water Vapor
Suh, D. and Yasuoka, K.
Goldschmidt 2016 （Yokohama, Japan） ,
2016年06月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of bubble formation from different colloid geometries
Suh, D. and Yasuoka, K.
6th International Colloids Conference （Berlin, Germany） ,
2016年06月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulation of Atmospheric Aerosol Growth from Water Vapor
Suh, D. and Yasuoka, K.
23rd Pacific Science Congress （Taipei, Taiwan） ,
2016年06月,口頭発表（一般）
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Adsorption Analysis on Solid Particle by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
12th International Conference on Fundamentals of Adsorption （Friedrichshafen, Germany） ,
2016年05月,口頭発表（一般）
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固液界面熱流動のナノ・レーザ計測と分子動力学の相互補完解析に向けて
山本憲, 土居勇人, 湯原大輔, 泰岡顕治, 佐藤洋平, 菱田公一
第53回日本伝熱シンポジウム （グランキューブ大阪（大阪府立国際会議場），大阪） ,
2016年05月,口頭発表（一般）
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ナノスリット細孔内の氷／水相平衡条件のレプリカ交換分子動力学シミュレーション
山光隆一, 野村昴太郎, 泰岡顕治
第53回日本伝熱シンポジウム （グランキューブ大阪（大阪府立国際会議場），大阪） ,
2016年05月,口頭発表（一般）
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キラル液晶の分子形状が相挙動に及ぼす影響
野澤拓磨, Paul Brumby, 泰岡顕治
第53回日本伝熱シンポジウム （グランキューブ大阪（大阪府立国際会議場），大阪） ,
2016年05月,口頭発表（一般）
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Equilibrium Properties of Methane Hydrate by Gibbs Ensemble Monte Carlo Simulations
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum A. K. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Car-Parrinello Molecular Dynamics Study of Guest-Host Interaction in Ammonia Clathrate Hdyrate
Hiratsuka, M., Ohmura, R., Sum, A. K., Alavi, S. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of heterogeneous ice nucleation on silver iodide surface
Takaiwa, D., Imai, N., Suh, D and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Non-Equilibrium Molecular Dynamics Simulation of Evaporation Process for Diatomic Molecule
Nomoto, Y., Sano, R., Hiratsuka, M., Takaiwa, D., Fujita, Y., Kondo, Y. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Aspect Ratio Effect of Nanorod Condensation by Molecular Dynamics
Suh, D.. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Prediction of Three Phase Equilibrium Points of Methane Hydrate by NVT Molecular Dynamics Simulation
Yuhara, D., Brumby, P. E., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
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Water Transport into Protein Inside in Active Rhodopsin: a Molecular Dynamics Study
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.
The First Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC) （Big Island, Hawaii, USA） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
-
Advantages of the Gibbs ensemble Monte Carlo method for the simulation of clathrate hydrates at equilibrium
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop 2016 on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
-
Prediction of the three-phase coexistence points for methane hydrate by NVT molecular dynamics simulation
Yuhara, D., Brumby, P. E., Wu, D. T., Sum A. K. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop 2016 on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2016年03月,口頭発表（一般）
-
Molecular dynamics study of ganglioside GM3/DPPC membrane by using coarse-grained model
Inoue, K., Yamamoto, E., Takaiwa, D., Yasuoka, K. and Mikami, M.
Biophysical Society Annual Meeting 60th （Los Angeles, USA） ,
2016年02月,ポスター発表
-
Water dynamics and ion interaction at channel entrance of aquaporin 1
Yamamoto, E., Akimoto, T., Yasui, M. and Yasuoka, K.
Biophysical Society Annual Meeting 60th （Los Angeles, USA） ,
2016年02月,ポスター発表
-
Effect of dipolar interactions on chiral liquid-crystal systems
Nozawa, T., Brumby, P. E. and Yasuoka, K.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,口頭発表（一般）
-
GPU-accelerated replica-exchange molecular dynamics simulation of freezing behavior in confined quasi-1D water
Nomura, K., Takaiwa, D., Bai, J., Yasuoka, K. and Zeng, X. C.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,口頭発表（一般）
-
Effect of electric field on water molecules confined in carbon nanotubes
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E. and Yasuoka, K.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,口頭発表（一般）
-
Solid-liquid and solid-solid phase transition of Lennard-Jones fluid in the cofined 2D system
Doi, H., Kaneko, T. and Yasuoka, K.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,ポスター発表
-
System-Size Dependency Analysis of Homogeneous Bubble Nucleation by Molecular Dynamics
Nakamura, M., Suh, D. and Yasuoka, K.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,口頭発表（一般）
-
Aerosol Formation of Water on Solid Seeds by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,ポスター発表
-
Evaluation of Viscoelastic Properties of Polyethylene Melt by Molecular Dynamics and Comparison with Coarse-Grained Molecular Dynamics
Nishimura, R., Takahashi, K., Z., Yasuoka, K. and Masubuchi, Y.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,ポスター発表
-
Self-assembly of Janus origomers into onion-like vesicles
Arai, N., Yasuoka, K. and Zeng, X. C.
The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015) （Honolulu, USA） ,
2015年12月,ポスター発表
-
Heterogeneous nucleation of bubbles by molecular dynamics
Suh, D., Nakamura, M. and Yasuoka, K.
9th International Symposium on Cavitation （Lausanne, Switzerland） ,
2015年12月,口頭発表（一般）
-
分子動力学法と粗視化分子動力学法を用いた高分子流体の粘弾性評価
西村龍斗, 高橋和義, 泰岡顕治, 増渕雄一
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年12月,ポスター発表
-
アクアポリンの水分子透過に関する分子シミュレーション
山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （金沢） ,
2015年12月,ポスター発表
-
分子動力学法による均一気泡核生成におけるシステムサイズ依存性の解析
中村光希, 徐東郁, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年12月,ポスター発表
-
アンモニアを含むクラスレート水和物のゲスト－ホスト間相互作用
平塚将起, 大村亮, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
密度汎関数法を用いた水素ハイドレート，窒素ハイドレートの振動解析
山田基, 平塚将起, David T. Wu, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
一次相転移現象に適したレプリカ交換法の変種の開発
土居英男, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会,
2015年11月,口頭発表（一般）
-
粗視化分子動力学シミュレーションを用いたGM3/DPPC膜の解析
井上堅斗, 山本詠士, 高岩大輔, 泰岡顕治, 三上益弘
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
粗視化分子モデルを用いたキラル液晶相の分子シミュレーション
野澤拓磨, Paul Brumby, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
ヨウ化銀表面における氷の不均一核生成に関する分子動力学シミュレーション
高岩大輔, 今井尚子, 徐東郁, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
単糖水和殻中の水分子振動スペクトル解析
友部勝文, 飯島崇, 山本詠士, 安井正人, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
形状による水の凝縮特性の分子動力学法を用いた解析
徐東郁, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
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固体表面への水滴の衝突及び跳ね返りの分子動力学シミュレーション
古石貴裕, 泰岡顕治, Xiao Cheng Zeng
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
分子動力学シミュレーションを用いたメタンハイドレートの相平衡状態の予測
湯原大輔, Paul Brumby, David T. Wu, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第29回分子シミュレーション討論会 （新潟） ,
2015年11月,ポスター発表
-
DFT Study of Ti Interstitial in Rutile TiO2 (110) Surface
Shibuya, T., Morita, K., Yasuoka, K., Mirbt, S. and Sanyal, B.
2nd International Symposium on Frontiers in Materials Science （Tokyo, Japan） ,
2015年11月,ポスター発表
-
Structures of water molecules in carbon nanotubes induced with electric field and its application for water-alcohol separation
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E. and Yasuoka, K.
International Conference on Mechanical and Manufacturing Engineering (ICMME) （Yogyakarta, Indonesia） ,
2015年11月,口頭発表（一般）
-
Formation of ordered structures of water in carbon nanotubes with electric fields
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E. and Yasuoka, K.
International Symposium on Current Progress in Mathematics and Sciences (ISCPMS) （Depok, Indonesia） ,
2015年11月,口頭発表（一般）
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糖鎖周りの水分子のスペクトル解析
友部勝文, 飯島崇, 山本詠士, 安井正人, 泰岡顕治
第36回日本熱物性シンポジウム （仙台） ,
2015年10月,口頭発表（一般）
-
アクアポリン細孔口での水分子とイオンの振る舞い
山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
第36回日本熱物性シンポジウム （仙台） ,
2015年10月,口頭発表（一般）
-
Molecular Dynamics Simulation of Water Vapor Forming Aerosols on Solid Precursor Particles
Suh, D. and Yasuoka, K.
AAAR 34th Annual Conference （Minneapolis, USA） ,
2015年10月,口頭発表（一般）
-
Molecular Dynamics Simulation of Aerosol Growth on Porous Precursor Particle
Suh, D., Yasuoka, K. and Zeng, X. C.
6th Asian Particle Technology Symposium （Seoul, Korea） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
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Water dynamics at channel entrance of aquaporin 1
山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
第53回日本生物物理学会年会 （金沢） ,
2015年09月,ポスター発表
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Structure-property of ganglioside GM3/DPPC membranes using coarse-grained molecular dynamics simulation
井上堅斗, 山本詠士, 高岩大輔, 泰岡顕治, 三上益弘
第53回日本生物物理学会年会 （金沢） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Toward a SAFT-type equation of state for nematic liquid crystals
Nozawa, T., Haslam, A., Jackson, G. and Yasuoka, K.
Coarse graining:force fields and simulation （London, UK） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
-
Cage occupancies in sI methane hydrates by Gibbs ensemble Monte Carlo simulation
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Coarse graining:force fields and simulation （London, UK） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
-
Phase equilibrium study of methane hydrate by NVT molecular dynamics simulation
Yuhara, D., Brumby, P. E., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Coarse graining:force fields and simulation （London, UK） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
-
Aerosol Growth MEchanisc Study for Elongated Particles by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
European Aerosol Conference （Milan, Italy） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulation of Condensation on Elongated Nanocuboids and nanotubes
Suh, D. and Yasuoka, K.
2nd International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,口頭発表（一般）
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Vibrational Analysis of Guest Diatomic Molecule in Clathrate Hydrate with Density Functional Theory
Yamada, M., Hiratsuka, M., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Evaluation of Analysis Methods of Methane Hydrate Nucleation by Molecular Dynamics Simulations
Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Molecular dynamics simulation of GM3/DPPC membrane with coarse-grained model
Inoue, K., Yamamoto, E., Takaiwa, D., Yasuoka, K. and Mikami, M.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Analysis on System Size Dependency of Homogeneous Bubble Nucleation by Molecular Dynamics Simulation
Nakamura, M., Suh, D. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Pathway for water molecule exchange between protein inside and bulk on active rhodopsin
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年09月,ポスター発表
-
Gibbs ensemble Monte Carlo simulations of cage occupancies in strucutre I methane hydrate
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年08月,口頭発表（一般）
-
"Water confined in carbon nanotubes under the influence of electric fields for water-alcohol separation"
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E. and Yasuoka, K.
4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems （Nagoya, Japan） ,
2015年08月,口頭発表（一般）
-
Atmospheric Aerosol Growth Study by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
International Conference on Environment （Penang, Malaysia） ,
2015年08月,口頭発表（一般）
-
Analysis of nucleation and phaxse equilibrium of methane hydrate by molecular dynamics simulation
Yuhara, D., Barnes, B. C., Suh, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Telluride Workshop "Clathrate Hydrates Fundamentals: Bridging Molecular Structures to Microscopic Properties and Behavior” （Telluride, USA） ,
2015年07月,口頭発表（一般）
-
Vibrational Analysis of Guest Molecule in Clathrate Hydrate with Density Functional Theory
Yamada, M., Hiratsuka, M., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Telluride Workshop "Clathrate Hydrates Fundamentals: Bridging Molecular Structures to Microscopic Properties and Behavior” （Telluride, USA） ,
2015年07月,口頭発表（一般）
-
Gibbs ensemble Monte Carlo simulations of sI methane hydrate
Brumby, P. E., Yuhara, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Telluride Workshop "Clathrate Hydrates Fundamentals: Bridging Molecular Structures to Microscopic Properties and Behavior” （Telluride, USA） ,
2015年07月,口頭発表（一般）
-
Investigation of chiral liquid-crystal phase transition of chiral liquid crystals
Nozawa, T., Brumby, P. E. and Yasuoka, K.
19th Symposium on Thermophysical Properties,
2015年06月,ポスター発表, Boulder, USA
-
Nucleation study for methane hydrate by molecular dynamics
Yuhara, D., Suh, D., Barnes, B. C., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
19th Symposium on Thermophysical Properties （Boulder, USA） ,
2015年06月,ポスター発表
-
Phase transition of Lennard-Jones fluid in the cofined system
Doi, H., Kaneko, T. and Yasuoka, K.
19th Symposium on Thermophysical Properties （Boulder, USA） ,
2015年06月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation on Aerosol Formation of Water
Suh, D. and Yasuoka, K.
Aerosol Technology （Tampere, Finland） ,
2015年06月,口頭発表（一般）
-
Molecular Dynamics Simulations of the Inhibition of Ice growth by Surfactant Molecules
Takaiwa, D., Shimazu, N., Kawaguchi, T., Kaneko, T., Fuse, T. and Yasuoka, K.
5th International Symposium on Micro and Nano Technology （Calgary, Canada） ,
2015年05月,口頭発表（一般）
-
Preferential Adsorption of Water-Methanol Mixture in Carbon Nanotubes with Eletric Field
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E. and Yasuoka, K.
5th International Symposium on Micro and Nano Technology （Calgary, Canada） ,
2015年05月,口頭発表（一般）
-
Water molecules structure confined in carbon nanotube and electric field and its separation effect
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., and Yasuoka, K.
International Workshop on Extended-nano Fluidics （Tokyo, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Interactions of Pleckstrin Homology domains with a model lipid membrane
Yamamoto, E., Kalli, A. C., Akimoto, T., Yasuoka, K., and Sansom M. S. P.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,口頭発表（一般）
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Car-Parrinello molecular dynamics study of guest-host interactions in fluoromethane clathrate hydrates
Hiratsuka, M., Ohmura, R., Sum, A., K., Alavi, S. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Molecular dynamics study of oleic acid membrane as a protocell model
Inoue, K., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Molecular dynamics study of GM3/DPPC membrane with Coarse-Grained Model
Inoue, K., Yamamoto, E., Takaiwa, D., Yasuoka, K., and Mikami, M.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Evaluation of Viscoelastic Properties of Polyethylene Melt by Molecular Dynamics Simulation
Nishimura, R., Takahashi, K., Z., Yasuoka, K. and Masubuchi, Y.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Evaluation of Viscoelastic Properties of Polyethylene Melt by Molecular Dynamics Simulation
Nishimura, R., Takahashi, K., Z., Yasuoka, K. and Masubuchi, Y.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
System Size Dependency Analysis of Homogeneous Bubble Nucleation by Molecular Dynamics
Nakamura, M., Suh, D. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
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Extension of the replica exchange method for the first order phase transition simulation and application to the confined Lennard-Jones system
Doi, H., Nomura, K., Narumi, T. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
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Vibrational analysis of guest molecules in clathrate hydrate with ab initio calculation
Yamada, M., Hiratsuka, M., Wu, D., T., Sum, A., K. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Constant pressure Gibbs ensemble Monte Carlo simulations of methane hydrate cage occupancy
Brumby, P.,E., Yuhara, D., and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
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The mechanism of ice growth inhibition by surfactant: A Molecular Dynamics Study
Shimazu, N., Takaiwa, D., Kawaguchi, T., Kaneko, T., Fuse, T. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
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A study of the influence of the ice-face exposed to liquid water phase on the melting point of hexagonal ice by means of direct coexistence simulation of rigid water models
Takaiwa, D., Sakamaki, R., Sum, A., K., Narumi, T., and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Ordered-structures of water molecules in carbon nanotubes induced with electric field
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Molecular Dynamics Simulations of Vapor-to-Liquid Nucleation on Various Solid Precursor Particle Configurations
Suh, D., Yasuoka, K. and Zeng, X., C.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
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Relation between evaporation and relaxation of vibrational energy using non-equilibrium molecular dynamics simulation of diatomic molecules
Nomoto, Y., Hiratsuka, M., Takaiwa, D., Fujita, Y., Kondo, Y., and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,ポスター発表
-
Molecular simulations on the effect of handling Coulomb interactions in liquid-crystal systems
Nozawa, T., Brumby, P. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,口頭発表（一般）
-
Nucleation study of methane hydrate from molecular dynamics simulation
Yuhara, D., Barnes, B. C., Suh, D., Wu, D. T., Sum, A. K. and Yasuoka, K.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,口頭発表（一般）
-
Replica Exchange Molecular Dynamics Simulation of Water and Ice Confined in Carbon Nanotube
Nomura, K., Bai, J., Yasuoka, K. and Zeng, X. C.
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,口頭発表（一般）
-
Hydration and water pathway of rhodopsin in active and inactive states
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.,
Global Environmental System Leaders (GESL) Workshop on Molecular Simulation （Yokohama, Japan） ,
2015年03月,口頭発表（一般）
-
Vibrations of water molecules in monosaccharide hydration shell by DFT-MD studies
Tomobe, K., Iijima, T., Yamamoto, E., Yasui, M. and Yasuoka, K.
Biophysical Society Annual Meeting 60th （Los Angeles, USA） ,
2015年03月,ポスター発表
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Anomalous Dynamics of Pleckstrin Homology Domains on Lipid Membrane Surfaces
Yamamoto, E., Kalli, A. C., Akimoto, T., Yasuoka, K., and Sansom, M. S. P.
Biophysical Society 59th Annual Meeting （Baltimore, Maryland, USA） ,
2015年02月,ポスター発表
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ポリエチレンのUAモデルとKremer-Grestモデルの比較
西村 龍斗, 高橋 和義, 泰岡 顕治, 増渕 雄一
2014年度 高分子計算機科学研究会・高分子ナノテクノロジー研究会 合同討論会 （東京） ,
2014年12月,口頭発表（一般）
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オレイン酸膜/水分子系における水分子 の輸送とフリップフロップ経路
井上 堅斗, 山本 詠士, 秋元 琢磨, 泰岡 顕治
第35回日本熱物性シンポジウム （東京） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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分子動力学シミュレーションによるイオン水溶液中のイオンクラスター形成のメカニズム解明
友部 勝文，山本 詠士，秋元 琢磨，安井 正人，泰岡 顕治
第35回日本熱物性シンポジウム （東京） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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分子動力学法とマルチスケール接続を利用した高分子の粘弾性予測法の開発
西村 龍斗, 高橋 和義, 泰岡 顕治, 増渕 雄一
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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散逸粒子動力学法を用いた Janus 粒子水溶液のシミュレーション
荒井規允，泰岡顕治，Xiao Cheng Zeng
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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Isotropic Periodic Sum 法を用いた液晶相転移の分子動力学シミュレーション
野澤拓磨，高橋和義，成見哲，泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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二つの励起方法による二原子分子の非平衡分子動力学シミュレーションを用いた振動エネルギー緩和と蒸発の関係の解明
野本悠介 ,平塚将起, 高岩大輔, 藤田雄樹, 近藤良夫, 泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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温度範囲や圧力範囲を指定できるマルチカノニカル法の変種の開発
土居英男, 泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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親水性分子を含むクラスレート水和物におけるゲスト-ホスト間水素結合
平塚将起，大村亮，Amadeu K. Sum，Saman Alavi，泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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分子動力学法とマルチスケール接続を利用した高分子の粘弾性予測法の開発
西村 龍斗, 高橋 和義, 泰岡 顕治, 増渕 雄一
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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濃度およびイオン種変化によるイオン形成過程の比較: 全原子分子動力学シミュレーション
友部勝文，山本詠士，Dusan Kojic，安井正人，泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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ヘマグルチニン/糖脂質分子を含む脂質膜系の祖視化モデルによるモデリング
井上堅斗，高岩大輔，泰岡顕治，三上益弘
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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種の形状による凝縮の特性の分子動力学法を用いた解析
徐東郁，泰岡顕治， Xiao Cheng Zeng
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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TiO2（110）における酸素欠陥周辺にある Ti3+状態の STM による直接観察：第一原理的アプローチ
澁谷泰蔵, 泰岡顕治, Susanne Mirbt, Biplab Sanyal
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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脂質二重膜上でのヌクレオチド二量体の構造とダイナミクスに関する研究
高岩大輔, 泰岡顕治, 戎崎俊一
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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分子動力学シミュレーションを用いたメタンハイドレートの核生成の解析
湯原大輔，Donguk Suh，Brian C. Barnes，David T. Wu，Amadeu K. Sum，泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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Pleckstrin-homology (PH) ドメインと細胞膜との相互作用
山本詠士，Antreas C. Kalli，秋元琢磨 ，Mark S. P. Sansom，泰岡顕治
第 28 回分子シミュレーション討論会 （仙台） ,
2014年11月,ポスター発表
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Origin of 1/f fluctuations of number of water molecules on lipid membrane surfaces
Yamamoto, E., Akimoto, T., Yasui, M., and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Comparison of conserved water molecules in rhodopsin and opsin: Molecular dynamics study
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Molecular dynamics study of glycolipids/lipids membrane with Coarse-Grained Model
Inoue, K., Takaiwa, D., Yasuoka, K., and Mikami, M.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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The water model dependency of the melting point of hexagonal ice
Takaiwa, D., Sakamaki, R., Sum, A. K., Narumi, T., and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Extended Study on Molecular Dynamics of Methane Hydrate Nucleation
Yuhara, D., Suh, D., Barnes B. C., Wu, D. T., Sum, A. K., and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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DFT study of Ti3+ states near oxygen vacancy on TiO2 (110): a new interpretation of STM
Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S. and Sanyal, B.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Pressure and temperature controlling in generalized isobaric-isothermal ensembles
Doi, H. and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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The effects of handling coulomb interaction on transport characteristic of liquid crystal system
Nozawa, T., Takahashi, K., Narumi, T. and Yasuoka, K.
International Symposium1on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Vibrational spectra of alcohol molecules in clathrate hydrates
Hiratsuka, M., Ohmura, R., Sum, A. K., Alavi, S., and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Preference of Water and Methanol Molecules Flowing into Carbon Nanotubes under Influence of Electric Field
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., and Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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Monte Carlo simulation of chiral liquid crystals with large pitch distances
Brumby, P., Yasuoka, K.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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Free energy surface of Water Confined in Slit Pores
Kaneko, T., Bai, J., Yasuoka, K., Mitsutake, A. and Zeng, X. C.
International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling:Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30) （Tokyo, Japan） ,
2014年11月,ポスター発表
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界面活性剤分子による氷結晶成長抑制の分子動力学シミュレーション
島津直弥, 高岩大輔, 川口暢, 金子卓, 布施卓哉, 泰岡顕治
日本機械学会 熱工学コンファレンス2014 （東京） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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脂質二重膜表面の水分子の個数の 1/f ゆらぎ
山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治
日本機械学会 熱工学コンファレンス2014 （東京） ,
2014年11月,口頭発表（一般）
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Flip-flop pathways of lipid molecules in a model membrane
Inoue, K., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
Dushanbe Symposium Computational Materials and Biological Sciences （Dushanbe, Tajikistan） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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Simulations of Vapor-to-Liquid Nucleation on Various Solid Precursor Particle Configurations by Molecular Dynamics
Suh, D., Yasuoka K., and Zeng, X.C.
Dushanbe Symposium Computational Materials and Biological Sciences （Dushanbe, Tajikistan） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of Rhodopsin and Opsin: Comparison of structure and hydration
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.
Dushanbe Symposium on Computational Materials and Biological Sciences （Dushanbe, Tajikistan） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
-
Molecular dynamics simulation of Rhodopsin and Opsin: Comparison of structure and hydration
Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K. and Yasuoka, K.
Dushanbe Symposium on Computational Materials and Biological Sciences （Dushanbe, Tajikistan） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
-
Flip-flop pathways of lipid molecules in a model membrane
Inoue, K., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
Dushanbe Symposium Computational Materials and Biological Sciences （Dushanbe, Tajikistan） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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Simulations of Vapor-to-Liquid Nucleation on Various Solid Precursor Particle Configurations by Molecular Dynamics
Suh, D., Yasuoka K., and Zeng, X.C.
7th Russian-Japanese Symposium on Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences （Moscow, Russia） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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Structural and hydration influence of pathogenic point mutation T188R: a molecular dynamics study
Tomobe, K., Yamamoto, E., Akimoto, E., Yasui, M. and Yasuoka, K.
Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences （Moscow, Russia） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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1/f noise in hydration dynamics on lipid membrane surfaces
Yamamoto, E., Akimoto, T., Yasui, M., Yasuoka, K.
Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences （Moscow, Russia） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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1/f noise in hydration dynamics on lipid membrane surfaces
Yamamoto, E., Akimoto, T., Yasui, M., Yasuoka, K.
Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences （Moscow, Russia） ,
2014年09月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulation of Aerosol Growth from Various Seed Configurations
Suh, D., Yasuoka K., and Zeng, X.C.
2014 International Conference on Aerosols （Busan, Korea） ,
2014年08月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulation of Aerosol Growth from Various Seed Configurations
Suh, D., Yasuoka K., and Zeng, X.C.
2014 International Conference on Aerosols （Busan, Korea） ,
2014年08月,口頭発表（一般）
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Materials modelling for energy and fuels: From photovoltaics to photocatalysis
Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S., Sanyal, B., Burton, A., L., Skelton, J., and Walsh, A.
248th ACS National Meeting and Exposition （San Francisco, USA） ,
2014年08月,ポスター発表
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Materials modelling for energy and fuels: From photovoltaics to photocatalysis
Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S., Sanyal, B., Burton, A., L., Skelton, J., and Walsh, A.
248th ACS National Meeting and Exposition （San Francisco, USA） ,
2014年08月,ポスター発表
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Nanoparticle Generation from Various Seed Particles by Molecular Dynamics
Suh, D., Yasuoka K., and Zeng, X.C.
International Conference on Nanotechnology: Fundamentals and Applications （Prague, Czech Republic） ,
2014年08月,口頭発表（一般）
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Excess electron trapping at surface oxygen vacancy in TiO2 : Origin of STM anomaly
Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S., and Sanyal, B.
248th ACS National Meeting and Exposition （San Francisco, USA） ,
2014年08月,ポスター発表
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GPU仮想化による耐故障性を考慮した分子動力学シミュレーション
老川 稔, 野村 昴太郎, 泰岡 顕治, 成見 哲
第145回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会（SWoPP2014）,
2014年07月,口頭発表（一般）
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Vibrational spectra of alcohol molecules in clathrate hydrates from ab initio MD simulations
Hiratsuka, M., Ohmura, R., Sum, A. K., and Yasuoka, K.
The 8th International Conference on Gas Hydrates （Beijing, China） ,
2014年07月,ポスター発表
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Analysis of Methane Hydrate Nucleation by Molecular Dynamics Simulation
Yuhara, D., Hiratsuka, M., Takaiwa, D., Ohmura, R., Sum, A. K., and Yasuoka, K.
The 8th International Conference on Gas Hydrates （Beijing, China） ,
2014年07月,ポスター発表
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Molecular dynamics simulations of vapor-to-liquid nucleation on various solid precursor particle configurations
Suh, D., Yasuoka K.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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Molecular dynamics simulation of preferential adsorption of denaturant molecules on hydrophilic and hydrophobic surfaces
Koishi, T., Yasuoka, K., Fujikawa, S., and Zeng, X.C.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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Molecular Dynamics simulation for liquid crystal system using isotropic periodic sum method
Nozawa, T., Takahashi, K. Z., Narumi, T., and Yasuoka, K.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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Phase transitions of water confined between two parallel hydrophobic surfaces
Kaneko, T., Bai, J., Yasuoka, K., Mitsutake, A., and Zeng, X.C.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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Self-assemby of triblock Janus nanoparticles solutions confined to a nanoslit using dissipative particle dynamics simulation
Arai, N., Yasuoka, K., and Zeng, X. C.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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Phase transitions of water confined between two parallel hydrophobic surfaces
Kaneko, T., Bai, J., Yasuoka, K., Mitsutake, A., and Zeng, X.C.
The 9th Liquid Matter Conference (Liquids 2014) （Lisbon, Portugal） ,
2014年07月,ポスター発表
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256GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
老川 稔, 野村 昴太郎, 川井 敦, 泰岡 顕治, 成見 哲
第18回計算工学講演会,
2014年06月,口頭発表（一般）
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クラスレート水和物内のゲスト分子の振動スペクトルが水分子から受ける影響の第一原理分子動力学を用いた解析
平塚将起, 大村亮, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第51回日本伝熱シンポジウム,
2014年05月,口頭発表（一般）
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二原子分子の非平衡分子動力学シミュレーションを用いた振動エネルギーの緩和と蒸発現象の関係の解明
野本悠介, 平塚将起, 高岩大輔, 藤田雄樹, 近藤良夫, 泰岡顕治
第51回日本伝熱シンポジウム,
2014年05月,口頭発表（一般）
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スリット型細孔中に閉じ込められた水分子の相転移
金子敏宏 ，Bai, J.，泰岡顕治，光武亜代理，Zeng, X. C.
日本物理学会第69回年次大会 （平塚） ,
2014年03月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics study of conserved water molecules in PrPc and pathological point mutation T188R
Tomobe, K., Yamamoto, E., Takuma, A., Yasui, M., and Yasuoka, K.
Biophysical Society 58th Annual Meeting （San Francisco, California, USA） ,
2014年02月,ポスター発表
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1/f fluctuations of amino acids generate non-Poisson water transportation in AQP1
Yamamoto, E., Akimoto,T., Hirano, Y., Yasui, M., and Yasuoka, K.
Biophysical Society 58th Annual Meeting （San Francisco, California, USA） ,
2014年02月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation of Vapor Condensation on Nanotubes
Suh, D., Yasuoka, K., and Zeng, X.
4th ASME Micro/Nano Heat and Mass Transfer International Conference （Hong Kong, China） ,
2013年12月,口頭発表（一般）
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分子動力学シミュレーションによる濃度に 依存したイオンの第 1, 2 水和殻の構造解析
友部勝文,山本詠士,安井正人,泰岡顕治
第34回日本熱物性シンポジウム （富山） ,
2013年11月,口頭発表（一般）
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アクアポリン内部の水分子透過に関する分子シミュレーション
山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治
第34回日本熱物性シンポジウム （富山） ,
2013年11月,口頭発表（一般）
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GPU Accelerated Replica Exchange Molecular Dynamics Simulation of Lennard-Jones Fluid
Nomura, K., Oikawa, M., Kawai, A., Narumi, T., and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Study of Water-Methanol Mixture Flowing into a Carbon Nanotube with Molecular Dynamics Simulation: Effect of Electric Field
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Molecular Dynamics Simulation on Conformational Fluctuation and Water Transport within AQP1
Yamamoto, E., Akimoto, T., Hirano, Y., Yasui, M., and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Analysis for Crystal Growth of Methane Hydrate from Molecular Dynamics Simulation
Yuhara, D., Takaiwa, D and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Guest-host hydrogen bond in sII and sH amyl-alcohol hydrate from molecular dynamics simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, and Kenji Yasuoka
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Phase Transitions of Water Confined in Slit Pores
Kaneko, T., Bai, J., Yasuoka, K., Mitsutake, A., and Zeng, X.C.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Relaxation modulus connection between Atomistic and Coarse-Grained Molecular Simulation of Polymer Melts using the Rouse Parameters
Yamato, N., Yonekawa, I., Takahashi, K. Z., Yasuoka, K., and Masubuchi Y.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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The concentration and halide ion effect of the ionic cluster
Tomobe, K., Yamamoto, E., Dusan, K.,Yasui, M., and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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DFT Study of Negatively Charged Oxygen Vacancy on (110) TiO2 Surface
Shibuya, T., Yasuoka, K., MIrbt, S., and Sanyal, B.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Anomalous water dynamics on the membrane surface
Akimoto, T., Yamamoto, E., Yasui, M., Yasuoka, K.,
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Heterogeneous Nucleation on Various Seed Configurations by Molecular Dynamics
Suh, D., Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Applications of a Linear-combination-based Isotropic Periodic Sum Method in Molecular Dynamics Simulations
Takahashi, K. Z., Nozawa, T., Kameoka, S., Narumi, T., Suh, D., Yasuoka, K.,
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Molecular Simulation of Confined Water and Aqueous Solution
Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,口頭発表（招待・特別）
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The dependence of ordering process on Coulombic interaction treatment 5CB system
Nozawa, T., Takahashi, K. Z., Narumi, T., and Yasuoka, K.
3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013) （Kobe, Japan） ,
2013年11月,ポスター発表
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Aging of water molecules on cell membrane surfaces
Yamamoto, E., Akimoto, T., Yasui, M., and Yasuoka, K.,
第51回生物物理学会年会 （京都） ,
2013年10月,ポスター発表
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Water behavior in buried hydration sites of human cellular prion protein and pathogenic mutation T188R
友部勝文，山本詠士，秋元琢磨，安井正人，泰岡顕治
第51回日本生物物理学会年会 （京都） ,
2013年10月,ポスター発表
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水/メタン界面におけるメタンハイドレートの結晶成長の分子動力学シミュレーション
湯原大輔，高岩大輔，泰岡顕治
日本機械学会熱工学コンファレンス2013 （弘前） ,
2013年10月,口頭発表（一般）
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5CB 液晶の秩序化における静電相互作用の影響
野澤拓磨, 高橋和義, 成見哲, 泰岡顕治
日本機械学会熱工学コンファレンス2013 （弘前） ,
2013年10月,口頭発表（一般）
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Molecular Simulation of Confined Fluid
Yasuoka, K.
The 4th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-4) （Shanghai, China） ,
2013年10月,口頭発表（招待・特別）
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First-principles calculations of the dielectric properties of SiO2 and TiO2 surface
Zhang, L., Shibuya, T., and Yasuoka, K.,
The 4th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-4) （Shanghai, China） ,
2013年10月,ポスター発表
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Water Transport Through a Carbon Nanotube with Molecular Dynamics Simulation
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
The 4th International Symposium on Micro and Nano Technology (ISMNT-4) （Shanghai, China） ,
2013年10月,口頭発表（一般）
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Molecular motion analysis of amyl-alcohol in structure II and H clathrate hydrates by molecular dynamics simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, and Kenji Yasuoka
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,口頭発表（一般）
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DFT study of the bipolaron formation due to oxygen vacancy on (110) TiO2 surface
Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S., and Sanyal, B.
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
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Molecular dynamics of 5CB with GPU accelerated Coulombic calculation
Takuma Nozawa, Kazuaki Takahashi, Tetsu Narumi, and Kenji Yasuoka
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
-
Molecular Dynamics Simulation of Heterogeneous Nucleation on Various Seed Shapes
Donguk Suh and Kenji Yasuoka
1st International Symposium on Material and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
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The behavior of conserved water molecules of PrPc and pathogenic mutation T188R by molecular dynamics simulations
Katsufumi Tomobe, Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka,
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
-
Connection of atomistic and coarse-grained molecular simulation of polymer melts based on the Rouse parameters
Nobuyoshi Yamato, Iori Yonekawa, Kenji Yasuoka, Yuichi Masubuchi
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
-
Study of Water-Methanol Mixture Flowing into Carbon Nanotubes with Molecular Dynamics Simulation
Winarto, Takaiwa, D., Yamamoto, E., Akimoto, T., and Yasuoka, K.
1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
-
Water Transportation in Aquaporin-1 Follows non-Poisson Statics
Yamamoto, E., Akimoto, T., Hirano, Y., Yasui, M., and Yasuoka, K.
1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,口頭発表（一般）
-
Analysis of Methane Hydrate Growth Rate from Molecular Dynamics Simulation
Yuhara, D., Takaiwa, D and Yasuoka, K.,
1st International Symposium on Conputer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
-
Molecular dynamics simulation of interaction of nucleotide with a phospholipid bilayer
Takaiwa, D., Yasuoka, K., and Ebisuzaki, T.
1st International Symposium on Computer Materials and Biological Sciences （Tokyo, Japan） ,
2013年09月,ポスター発表
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Ab initio Calculations of Vibrational Spectra and Guest - Host Interaction in Clathrate Hydrate
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, and Kenji Yasuoka
16th International Conference on the Properties of Water and Steam （London, UK） ,
2013年09月,口頭発表（一般）
-
The melting point of hexagonal ice from the isobaric-isoenthalpic molecular dynamics simulation
Takaiwa, D., Sakamaki, R., Sum, A.K., Narumi, T., and Yasuoka, K.
16th International Conference on the Properties of Water and steam, London （London, UK） ,
2013年09月,口頭発表（一般）
-
Origin of Anomalous Feature of WaterMolecules on Membrane Surface
Yamamoto, E., Akimoto, T., Hirano, Y., Yasui, M., and Yasuoka, K.
16th International Conference on the Properties of Water & Steam （London, UK） ,
2013年09月,口頭発表（一般）
-
The role of beta sheets formation in the early stage self-assembly of peptide amphiphile worm-like micelles: A replica-exchange molecular dynamics study
Kaneko, T., Hara, T., Mitsutake, A., and Yasuoka, K.
7th Mini-Symposium on Liquids （Fukuoka, Japan,） ,
2013年07月,ポスター発表
-
Molecular Dynamics Simulation of Heterogeneous Nucleation on Nanorods
Donguk Suh, Kenji Yasuoka, and Xiao Cheng Zeng
19th International Conference on Nucleation and Atmospheric Aerosols （Fort Collins） ,
2013年06月,口頭発表（一般）
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棒状液晶の分子動力学シミュレーションにおける静電相互作用の影響
野澤拓磨, 亀岡駿, 高橋和義, 成見哲, 泰岡顕治
第17回液晶化学研究会シンポジウム （つくば） ,
2013年06月,ポスター発表
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固液平衡条件を定量的に決定するための手法開発とナノ細孔中の水分子への適用
金子敏宏，Bai, J.，泰岡顕治，光武亜代理，Zeng, X. C.
第50回日本伝熱シンポジウム （仙台） ,
2013年05月,口頭発表（一般）
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GPU を用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションによる Lennard-Jones 流体の固液相転移点の推定
野村昴太郎, 老川稔, 川井敦, 成見哲, 泰岡顕治
第50回日本伝熱シンポジウム （仙台） ,
2013年05月,口頭発表（一般）
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ゲスト-水分子間相互作用がクラスレート水和物の振動スペクトルに及ぼす影響の第一原理分子動力学シミュレーション
平塚将起, 大村亮, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第50回日本伝熱シンポジウム （仙台） ,
2013年05月,ポスター発表
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Heterogeneous Nucleation on Nanorods and Nanotubes by Molecular Dynamics
Donguk Suh and Kenji Yasuoka
17th Research Workshop: Nucleation Theory and Applications （Dubna, Russia） ,
2013年04月,口頭発表（一般）
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Heterogeneous Water Vapor Nucleation Inside Carbon Nanopores
Kh. Kholmurodov, E. Dushanov, R. Eremin, Donguk Suh, and Kenji Yasuoka
17th Research Workshop: Nucleation Theory and Applications （Dubna, Russia） ,
2013年04月,口頭発表（一般）
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Molecular Simulation of formation for dimer of RNA substance and membrane
Kenji Yasuoka
1ST Earth-Life Science Institute International Symposium （Tokyo） ,
2013年03月,口頭発表（招待・特別）
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Estimation of Breakdown Electric-Field Strength of Defective Silicon Dioxide Gate Dielectrics Using First-Principles Molecular Orbital Calculation Technique
関洋, 渋谷寧浩, 野平博司, 小林大輔, 泰岡顕治, 廣瀬和之
第17回 ゲートスタック研究会 （静岡） ,
2013年01月,口頭発表（一般）
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凹凸面に衝突したときの水滴の内部圧力の導出
古石貴裕，泰岡顕治，X. C. Zeng，藤川茂紀
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
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剛体水モデルにおける水/氷共存状態の分子動力学シミュレーション
高岩大輔, 坂牧隆司, Amadeu K. Sum, 成見哲, 泰岡顕治
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
-
散逸粒子動力学シミュレーションによるナノチューブ内におけるトリブロックJanus 粒子の自己集合構造
荒井規允, 泰岡顕治, X. C. Zeng
第26回分子シミュレーション討論 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
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脂質二重膜周りの水分子の異常拡散
山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
-
GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
野村昴太郎, 老川稔, 川井敦, 成見哲, 泰岡顕治
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
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ナノ細孔中の分子の固液平衡条件を決定するための新規手法の開発", 第26回分子シミュレーション討論会
金子敏宏, J. Bai, 泰岡顕治, 光武亜代理, X. C. Zeng
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
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分子クラスターにおけるポテンシャルエネルギー曲面上のダイナミクス
秋元琢磨, 金子敏宏, 泰岡顕治, X. C. Zeng
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
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拡張アンサンブル分子動力学法による単純液体の固液相転移温度の推定
増永充宏, 金子敏宏, 光武亜代理, 泰岡顕治
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
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Shape Effect Study on Heterogeneous Nucleation by Molecular Dynamics
徐東郁, 泰岡顕治
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
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Rouse パラメータを用いた原子レベル分子動力学法と粗視化分子動力学法の接続
大和伸好, 泰岡顕治, 増渕雄一
第26回分子シミュレーション討論会 （福岡） ,
2012年11月,ポスター発表
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Distributed-Shared CUDA: Virtualization of Large-Scale GPU Systems for Programmability and Reliability
Atsushi Kawai, Kenji Yasuoka, Kazuyuki Yoshikawa, Tetsu Narumi
The Fourth International Conference on Future Computational Technologies and Applications, FUTURE CONPUTING 2012 （Nice, France） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
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Vibrational Spectra of Amyl-Alcohol Molecules in Clathrate Hydrates from Ab initio Molecular Dynamics Simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
The Seventh General Meeting of ACCMS-VO （Sendai, Japan） ,
2012年11月,ポスター発表
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DS-CUDA: a Middleware to Use Many GPUs in the Cloud Environment
Minoru Oikawa, Atsushi Kawai, Kentaro Nomura, Kazuyuki Yoshikawa, Kenji Yasuoka, Tetsu Narumi
SC12 （Salt Lake City, USA） ,
2012年11月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulation on Homogeneous Nucleation of Methanol
Suh Donguk, Gaku Machida, Kenji Yasuoka
3rd International Forum on Heat Transfer （Nagasaki, Japan） ,
2012年11月,ポスター発表
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Hybrid functional DFT study of Polarons due to Oxygen Vacancy formation on (110) TiO2 Surface
Taizo Shibuya, Kenji Yasuoka, Susanne Mirbt, Biplab Sanyal
ASIAN-15 （Taipei, Taiwan） ,
2012年11月,ポスター発表
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Heterogeneous Nucleation of Nanoscale Seed Particles by Molecular Dynamics
Suh Donguk, Kenji Yasuoka
9th Iberoamerican Conference on Phase Equilibria and Fluid Properties for Process Design （Puerto Baras, Chile） ,
2012年10月,口頭発表（一般）
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分子動力学シミュレーションによる細胞膜周りの水分子の温度依存性の解析
山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治
第33回日本熱物性シンポジウム （大阪） ,
2012年10月,口頭発表（一般）
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Direct Observations of Flip-flops in Membranes
秋元琢磨, 荒井規允, 山本詠士, 安井正人, 泰岡顕治
第50回日本生物物理学会年会 （名古屋） ,
2012年09月,口頭発表（一般）
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Mean Exit Time Analysis about Water Molecules around Membrane Surfaces
山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治
第50回日本生物物理学会年会 （名古屋） ,
2012年09月,口頭発表（一般）
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Dynamics of Water Molecules around a Lipid Bilayer
Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka, Masato Yasui
International Workshop MSSMBS 2012 （Dubuna, Russia,） ,
2012年09月,口頭発表（一般）
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Molecular motions of guest molecules in clathrate hydrates: ab initio molecular dynamics simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
International Workshop MSSMBS 2012 （Dubuna, Russia） ,
2012年09月,口頭発表（一般）
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Car-Parrinello molecular dynamics simulations with Grimme vdW correction for clathrate hydrates consisting of alcohol and fluorocarbon molecules
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
4th EuCheMS Chemistry Congress （Prague, Czech Republic） ,
2012年08月,ポスター発表
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Connection of atomistic and coarse-grained molecular simulation of polymer melts based on the Rouse parameter
Nobuyoshi Yamato, Iori Yonekawa, Kenji Yasuoka, Yuichi Masubuchi
The XVIth International Congress on Rheology （Lisbon, Portugal） ,
2012年08月,ポスター発表
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Size-Dependent Phase Transitions in TIP4P Water Clusters Investigated by Multicanonical-Ensemble Molecular Dynamics Simulations
Toshihiro Kaneko, Takuma Akimoto, Kenji Yasuoka, Ayori Mitsutake, Xiao Cheng Zeng
Energy Landscapes （Obergurgl, Austria） ,
2012年07月,口頭発表（一般）
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Ab initio Molecular Dynamics Simulations for Molecular Vibrations and Motions of Guest Molecules in Clathrate Hydrates
泰岡 顕治
Tellluride Workshop on the Microscopic of Gas Hydrate （Telluride, USA） ,
2012年07月,口頭発表（一般）
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Kinetic Analysis on Nanoparticle Condensation by Molecular Dynamics
Suh, D. and Yasuoka, K.
ASME 10th International Conference on Nanochannels （Puerto Rico, USA） ,
2012年07月,口頭発表（一般）
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Multibaric-multithermal ensemble simulation of water confined in slit pores
金子敏宏, 泰岡顕治, 光武亜代理, X. C. Zeng
The 6th Mini-Symposium on Liquids （福岡） ,
2012年06月,ポスター発表
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Oxygen vacancy formation on (110) TiO2 surface - a first principles study
Taizo Shibuya, Kenji Yasuoka, Susanne Mirbt, Biplab Sanyal
Frontiers in Electronic Materials: Correlation Effects and Memristive Phenomena (Nature Conference) （Aachen, Germany） ,
2012年06月,ポスター発表
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GPU仮想化による自動冗長計算システム
吉川和幸, 川井敦, 泰岡顕治, 成見哲
第134回ハイパフォーマンスコンピューティング研究発表会 （東京） ,
2012年06月,口頭発表（一般）
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クラスレート水和物のゲスト-水分子間水素結合が分子運動へ及ぼす影響の第一原理分子動力学シミュレーション
平塚将起, 大村亮, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第49回日本伝熱シンポジウム （富山） ,
2012年05月,口頭発表（一般）
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拡張アンサンブル分子動力学法によるスリット型細孔中に閉じ込められた水分子の融点の推定
金子敏宏, 泰岡顕治, 光武亜代理, X. C. Zeng
第49回日本伝熱シンポジウム （富山） ,
2012年05月,ポスター発表
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分子動力学シミュレーションによる脂質二重膜周りの水分子のダイナミクスの解析
山本詠士,秋元琢磨,平野秀典,安井正人,泰岡顕治
第17回計算工学講演会 （京都） ,
2012年05月,口頭発表（一般）
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GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化
野村昴太郎，坂牧隆司，成見哲，泰岡顕治
第17回計算工学講演会 （京都） ,
2012年05月,口頭発表（一般）
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Hybrid functional DFT study of oxygen vacancy on (110) TiO2 surface
Taizo Shibuya, Kenji Yasuoka, Susanne Mirbt, Biplab Sanyal
Psi-k Research Conference on Computational Oxide Spintronics （Cheshire, UK） ,
2012年05月,ポスター発表
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Heterogeneous Nucleation Analysis on a Cubic Seed by Molecular Dynamics
Suh Donguk, Kenji Yasuoka
15th Research Workshop: Nucleation Theory and Applications （Dubuna, Russia） ,
2012年04月,口頭発表（一般）
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Energy landscape network in a water cluster
Takuma Akimoto, Toshihiro Kaneko, and Kenji Yasuoka
The 5th Discussion Meeting on Glass Transition （Sendai, Japan） ,
2012年02月,ポスター発表
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A Possible Mechanism on Pressure Reversal of General Anesthesia in Membrane
Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka, Masato Yasui
Biophysical Society 56th annual meeting （San Diego, California, USA） ,
2012年02月,ポスター発表
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凹凸面における水滴の接触角ヒステリシスの導出
古石貴裕，泰岡顕治，X. C. Zeng，藤川茂紀
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,口頭発表（一般）
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拡張アンサンブル分子動力学法を用いたLennard-Jones流体の固液相転移温度の推定
増永充宏，金子敏宏，光武亜代理，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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ナノチャネルに閉じ込められた界面活性剤水溶液の散逸粒子動力学シミュレーション
荒井規允，泰岡顕治，X. C. Zeng
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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Direct Coexistence法を用いた固液または気液平衡の分子シミュレーション
坂牧隆司，Amadeu K. Sum，成見哲，大村亮，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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Lennard-Jones液体の結晶核生成過程における不純物分子特性の影響
高井北斗，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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棒状液晶のマルチスケール分子動力学シミュレーション
米川伊織，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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氷タンパク質表面上の薄膜水の挙動
村上大介，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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脂質2重膜における粘弾性とトラップ時間のベキ則
秋元琢磨，山本詠士，泰岡顕治，平野秀典，安井正人
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,口頭発表（一般）
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ハイブリッド汎関数を用いたルチル型 TiO2(110) 表面における酸素欠陥由来の磁性状態の解析
澁谷泰蔵，S. Mirbt，B. Sanyal，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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拡張アンサンブル分子動力学による低分子系の固液相転移現象の研究
金子敏宏，泰岡顕治，光武亜代理，X. C. Zeng
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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LIPS法:均一系および不均一系の長距離相互作用計算に対応した一般化IPS法の開発
高橋和義，成見哲，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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外圧の増加が脂質二重膜内のキセノン分子へ与える影響
山本詠士，秋元琢磨，平野秀典，泰岡顕治，安井正人
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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アルコールハイドレートの第一原理分子動力学シミュレーション
平塚将起，大村亮，泰岡顕治
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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Condensation on cubic seeds by molecular dynamics
D. Suh，K. Yasuoka
第25回分子シミュレーション討論会 （東京） ,
2011年12月,ポスター発表
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大規模GPUとFMMを用いた一様等方性乱流の解析
横田理央，成見哲, Barba Lorena，泰岡顕治
第19回ハイパフォーマンスコンピューティングとアーキテクチャの評価に関する北海道ワークショップ (HOKKE19) （札幌） ,
2011年11月,口頭発表（一般）
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拡張アンサンブル分子動力学法を用いた単純液体の固液相転移温度の推定
金子敏宏，増永充宏，光武亜代理，泰岡顕治
第32回日本熱物性シンポジウム （横浜） ,
2011年11月,口頭発表（一般）
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水／キセノン／脂質二重膜の分子動力学シミュレーション
山本詠士， 秋元琢磨，平野秀典，泰岡顕治，安井正人
第32回日本熱物性シンポジウム （横浜） ,
2011年11月,口頭発表（一般）
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疎水性のストライプパターンを持つナノチャネルに閉じ込められた界面活性剤水溶液のモルフォロジーおよびダイナミクス
荒井規允，泰岡顕治，X. C. Zeng
第59回レオロジー討論会 （桐生） ,
2011年10月,口頭発表（一般）
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Estimation of breakdown electric-field strength reflecting local structures of SiO2 by using first-principles molecular orbital calculation technique
Hiroshi Seki, Yasuhiro Shibuya, Daisuke Kobayashi, Nohira Hiroshi, Yasuoka Kenji, Hirose Kazuyuki
International Conference on Solid State Devices and Materials （Nagoya, Japan） ,
2011年09月,ポスター発表
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分子クラスターの動的共存現象とサイズ依存性
金子敏宏，秋元琢磨，泰岡顕治，光武亜代理，Xiao Cheng Zeng
可視化情報学会全国講演会 （富山） ,
2011年09月,口頭発表（一般）
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第一原理分子動力学シミュレーションを用いたクラスレート水和物の振動解析
平塚将起，大村亮，Amadeu K. Sum，泰岡顕治
可視化情報学会全国講演会 （富山） ,
2011年09月,口頭発表（一般）
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拡張アンサンブル法を用いた低分子系の相転移現象の研究
金子敏宏，泰岡顕治，光武亜代理，Xiao Cheng Zeng
第二回計算統計物理学研究会 （金沢） ,
2011年09月,口頭発表（一般）
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脂質2 重膜におけるベキ的なトラップによる輸送係数の非ガウス的揺らぎ
秋元琢磨，山本詠士，泰岡顕治，平野秀典，安井正人
日本物理学会2011 年秋季大会 （富山） ,
2011年09月,口頭発表（一般）
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Molecular Dynamics Simulations on Pressure Reversal of General Anesthesia in a Lipid Bilayer
Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Kenji Yasuoka, Yoshinori Hirano, Masato Yasui
第49回生物物理学会年会 （姫路） ,
2011年09月,口頭発表（一般）
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Dissipative Particle Dynamics Simulation for Surfactant Solution in Confined System
Noriyoshi Arai, Kenji Yasuoka, Xiao Cheng Zen
The 2nd international symposium on "Multi-scale Simulations of Biological and Soft Materials" (MSBSM2011) （Kyoto, Japan） ,
2011年09月,ポスター発表
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Multiscale simulation of entangled polymer melts
Iori Yonekawa, Kenji Yasuoka, Yuichi Masubuchi
The 2nd international symposium on "Multi-scale Simulations of Biological and Soft Materials" (MSBSM2011) （Kyoto, Japan） ,
2011年09月,ポスター発表
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Accelerating Classical Molecular Simulations on a GPU cluster
Ryuji Sakamaki, Rio Yokota, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
The 2nd international symposium on "Multi-scale Simulations of Biological and Soft Materials" (MSBSM2011) （Kyoto, Japan） ,
2011年09月,ポスター発表
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Non-Gaussian Fluctuations Resulting from Long Time Trapping in Lipid Bilayers
Takuma Akimoto, Eiji Yamamoto, Kenji Yasuoka, Yoshinori Hirano, Masato Yasui
The 2nd international symposium on "Multi-scale Simulations of Biological and Soft Materials" (MSBSM2011) （Kyoto, Japan） ,
2011年09月,ポスター発表
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Aerosol growth analysis based on various seed types by molecular dynamic
Donguk Suh, Kenji Yasuoka
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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Multiscale simulation of rod-like liquid crystals
Iori Yonekawa, Kenji Yasuoka
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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Dissipative Particle Dynamics Simulation for Surfactant Solution Confined to Nanochannel with Striped Janus Surfaces
Noriyoshi Arai, Kenji Yasuoka, Xiao Cheng Zeng
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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Isobaric-multithermal ensemble simulation of simple liquids confined in slit pores
Toshihiro Kaneko, Kenji Yasuoka, Ayori Mitsutake, Xiao Cheng Zeng
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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Non-Gaussian luctuation of Time-averaged Mean Square Displacement in Lipid Bilayer
Takuma Akimoto, Eiji Yamamoto, Kenji Yasuoka, Yoshinori Hirano, Masato Yasui
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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Solid/liquid and liquid/vapor equilibria for common water models
Ryuji Sakamaki, Amadeu Sum, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
8th Liquid Matter Conference （Wien, Austria） ,
2011年09月,ポスター発表
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第一原理分子軌道計算によるSiO2の局所構造を反映した絶縁破壊電界の推定
関洋，渋谷寧浩，小林大輔，野平博司，泰岡顕治，廣瀬和之
第72回応用物理学術講演会 （山形） ,
2011年08月,口頭発表（一般）
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Calculation of interfacial tensions between hydrate and liquid phases using molecular simulation
Ryuji Sakamaki, Kenji Yasuoka, Eric M. Grzelak, David T. Wu, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum
7th International Conference on Gas Hydrates ICGH7 2011 （Edinburgh, UK） ,
2011年07月,ポスター発表
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Vibrational spectra of methane clathrate hydrates from ab initio molecular dynamics simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
7th International Conference on Gas Hydrates ICGH7 2011 （Edinburgh, UK） ,
2011年07月,ポスター発表
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Phase equilibria for common water models
Ryuji Sakamaki, Amadeu K. Sum, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
The 5th International Mini-Symposium on Liquids （Okayama, Japan） ,
2011年06月,ポスター発表
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Dynamical coexistence and size dependence of water cluster
Toshihiro Kaneko, Takuma Akimoto, Kenji Yasuoka, Ayori Mitsutake, Xiao Cheng Zeng
The 5th International Mini-Symposium on Liquids （Okayama, Japan） ,
2011年06月,ポスター発表
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Extended study of bubble nucleation using molecular dynamics simulation
Takaaki. Tsuzuki, Donguk Suh, Kenji Yasuoka
85th ACS Colloid and Surface Science Symposium （Montreal, Canada） ,
2011年06月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation on nanoparticle growth based on various seed types
Donguk Suh, Kenji Yasuoka
85th ACS Colloid and Surface Science Symposium （Montreal, Canada） ,
2011年06月,口頭発表（一般）
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A combination of the Tree code and IPS method to simulate large scale systems by molecular dynamics
Kazuaki Takahashi, Ryuji Sakamaki., Rio Yokota, Lorena A. Barba, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
International Conference on Computational Science (ICCS2011) （Singapore） ,
2011年06月,口頭発表（一般）
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スリット型細孔に閉じ込められた単純液体の固液相転移
金子敏宏，泰岡顕治，光武亜代理，X. C. Zeng
第48回日本伝熱シンポジウム （岡山） ,
2011年06月,口頭発表（一般）
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第一原理分子動力学法を用いた構造Hハイドレートの振動スペクトル解析
平塚将起，大村亮，Amadeu K. Sum，泰岡顕治
第48回日本伝熱シンポジウム （岡山） ,
2011年06月,口頭発表（一般）
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Heterogeneous Nucleation based Nanoparticle Growth Analysis by Molecular Dynamics
Donguk Suh, Kenji Yasuoka
15th Research Workshop: Nucleation Theory and Applications （Dubna, Russia） ,
2011年04月,口頭発表（一般）
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Cutoff Radius Effect of Water Configuration Using the Wolf Method
Kazuaki Takahashi, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
The 8th ASME-JSME Thermal Engineering Joint Conference （Hawaii, USA） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
-
第一原理分子軌道計算を用いたSi・Al化合物の絶縁破壊電界の推定
関洋、渋谷寧浩、野平博司、小林大輔、泰岡顕治、廣瀬和之
第57回春季応用物理学会 （神奈川） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
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Lennard-Jones 液体の結晶核生成過程における不純物の影響の解析
高井北斗，泰岡顕治
日本物理学会2011年春期大会 （新潟） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of quasi-two-dimensional water network on ice nucleation protein
Daisuke Murakami, Kenji Yasuoka
The 8th ASME-JSME Thermal Engineering Joint Conference （Hawaii, USA） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
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Multicanonical Molecular Dynamics Simulation Study of the Liquid-Solid and Solid-Solid Transitions in Lennard-Jonse Clusters
Toshihiro Kaneko, Kenji Yasuoka, Ayori Mitsutake, Xiao Cheng Zeng
The 8th ASME-JSME Thermal Engineering Joint Conference （Hawaii, USA） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
-
Molecular Dynamics Simulation of Three-Dimensional Heterogeneous Nucleation
Donguk Suh, Kenji Yasuoka
The 8th ASME-JSME Thermal Engineering Joint Conference （Hawaii, USA） ,
2011年03月,口頭発表（一般）
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第一原理分子軌道計算を用いたSi・Al化合物の絶縁破壊電界の推定
関洋、渋谷寧浩、野平博司、小林大輔、泰岡顕治、廣瀬和之
第16回ゲートスタック研究会 （東京） ,
2011年01月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation for vapor-liquid homogeneous nucleation
Kenji Yasuoka
The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies （Hawaii, USA） ,
2010年12月,口頭発表（招待・特別）
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電解液中における脂質二重層膜の流動性低下と水のダイナミクス変化との関係
香川璃奈，平野秀典，泰岡顕治，安井正人
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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ネマティック液晶のマルチスケール分子動力学シミュレーション
米川伊織, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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キセノン分子と圧力が脂質二重膜に与える影響に関する分子動力学計算
山本詠士, 秋元琢磨, 泰岡顕治, 平野秀典, 安井正人
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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第一原理分子動力学法を用いた構造I・構造Hクラスレート水和物中メタン分子の振動スペクトル解析
平塚将起, 大村亮, Amadeu K. Sum, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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気泡生成を利用した高効率ナノモーターシステムの分子シミュレーション
荒井規允, 泰岡顕治, 古石貴裕, 戎崎俊一
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,口頭発表（一般）
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マルチカノニカル分子動力学法による分子クラスターの転移現象の解明
金子敏宏，秋元琢磨，泰岡顕治，光武亜代理，Xiao Cheng Zeng
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,口頭発表（一般）
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脂質 2 重膜における脂質の拡散の解析
秋元琢磨, 山本詠士, 泰岡顕治, 平野秀典, 安井正人
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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Seed characteristics analysis for heterogeneous nucleation
Donguk Suh, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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Isotropic Periodic Sum法とParticle-Particle Particle-Cell 法を組み合わせた長距離相互作用計算手法の開発
高橋和義, 成見哲, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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Lennard-Jones 流体の気泡核生成現象における分子動力学法と古典核生成理論の比較
都築孝明, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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第一原理分子動力学法によるシリカガラス表面のエタノール分子の解析
佐藤豪洋, 泰岡顕治
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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散逸粒子動力学法を用いたアクアポリンの自己集合
柏木弘毅, 秋元琢磨, 泰岡顕治, 荒井規允, 平野秀典, 安井正人
第24回分子シミュレーション討論会 （福井） ,
2010年11月,ポスター発表
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散逸粒子動力学法による紐状ミセルのせん断誘起構造の解析
荒井規允, 泰岡顕治, 増渕雄一
第58回レオロジー討論会 （宮城） ,
2010年10月,口頭発表（一般）
-
第一原理分子軌道計算を用いたSi・Al化合物の絶縁破壊電界の推定
関洋、渋谷寧浩、野平博司、小林大輔、泰岡顕治、廣瀬和之
第71回応用物理学会学術講演会 （長崎） ,
2010年09月,口頭発表（一般）
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Vibrational spectra of methane molecule in the structure I clathrate hydrate from ab initio molecular dynamics simulations
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
12th International Conference on the Physics and Chemistry of Ice （Sapporo, Japan） ,
2010年09月,口頭発表（一般）
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Molecular dynamics simulation of water adsorbed on ice nucleation protein
Daisuke Murakami, Kenji Yasuoka
International Workshop MSSMBS-2010 "Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences" （Moscow, Russia） ,
2010年09月,口頭発表（一般）
-
Multiscale simulation of nematic liquid crystals
Iori Yonekawa, Kenji Yasuoka
International Workshop MSSMBS-2010 "Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences" （Moscow, Russia） ,
2010年09月,口頭発表（一般）
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Self-Assembly of Aqueous Surfactant Solutions in Nanotubes
Noriyoshi Arai, Kenji Yasuoka, Yuichi Masubuchi
5-th Pacific Rim Conference on Rheology （Sapporo, Japan） ,
2010年08月,口頭発表（一般）
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Cutoff Radius Effect of Isotropic Periodic Sum Method in Water Homogeneous/Heterogeneous System
Kazuaki Takahashi, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
ICCT-2010 the 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics （Tsukuba, Japan） ,
2010年08月,口頭発表（一般）
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Seed Characteristics Analysis of Nanoparticle Growth by Heterogeneous Nucleation
Donguk Suh, Kenji Yasuoka
The 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics （Tsukuba, Japan） ,
2010年08月,口頭発表（一般）
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Phase diagram of Lennard-Jones fluid confined in slit pores
Toshihiro Kaneko, Kenji Yasuoka, Xiao Cheng Zeng
The 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics （Tsukuba, Japan） ,
2010年08月,口頭発表（一般）
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Accelerating Molecular Dynamics Simulation on GPGPU
Ryuji Sakamaki, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
9th World Congress on Computational Mechanics and 4th Asian Pacific Congress on Computational Mechanics （Sydney, Australia） ,
2010年07月,口頭発表（一般）
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Free Energy Calculation of Clathrate Hydrates / Vibrational Spectra of Methane in Structure-1
Kenji Yasuoka
Telluride Workshop on the Microscopic Description of Gas Clathrate （Telluride, USA） ,
2010年07月,口頭発表（一般）
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Accelerating molecular simulations to investigate the properties of clathrate hydrate by using Graphic Processing Units
Ryuji Sakamaki, Ryo Ohmura, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
Telluride Workshop on the Microscopic Description of Gas Clathrate （Telluride, USA） ,
2010年07月,口頭発表（一般）
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Surface Tension of Water with Rigid Models
Kenji Yasuoka
The International Association for the Properties of Water and Steam 2010 Annual Meeting （Ontario, Canada） ,
2010年07月,口頭発表（一般）
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The melting points of molecular cluster studied by Multicanonical ensemble
金子敏宏, 泰岡顕治, 光武亜代理, Xiao Cheng Zeng
The 4th Mini-Symposium on Liquids （福岡） ,
2010年06月,ポスター発表
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Vibrational spectra of clathrate hydrates from ab initio molecular dynamics simulation
Masaki Hiratsuka, Ryo Ohmura, Kenji Yasuoka
Clathrate Hydrates and Technology Innovations - Challenges Toward a Symbiotic Energy Paradigm （Yokohama, Japan） ,
2010年03月,ポスター発表
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Potential Model Dependency of Thermodynamical Properties on Methane/Water Interface
Ryuji Sakamaki, Ryo Ohmura, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
Clathrate Hydrates and Technology Innovations - Challenges Toward a Symbiotic Energy Paradigm （Yokohama, Japan） ,
2010年03月,ポスター発表
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Thermodynamic Stability on Fluorocarbon Clathrate Hydrates
Fumihito Takeuchi, Ryo Ohmura, Kenji Yasuoka
Clathrate Hydrates and Technology Innovations - Challenges Toward a Symbiotic Energy Paradigm （Yokohama, Japan） ,
2010年03月,ポスター発表
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Calculation of Phase Equilibrium Condition and Occupancy Ratio of Clathrate Hydrate by Gibbs Ensemble Monte Carlo
Hayato Aida, Ryuji Sakamaki, Fumihito Takeuchi, Ryo Ohmura, Amadeu K. Sum, Kenji Yasuoka
Clathrate Hydrates and Technology Innovations - Challenges Toward a Symbiotic Energy Paradigm （Yokohama, Japan） ,
2010年03月,ポスター発表
-
拡張アンサンブル分子動力学法によるスリット細孔に閉じ込められたLennard-Jones粒子の固液相転移
金子敏宏, 美馬俊喜, 光武亜代理, 泰岡顕治
スーパーコンピューターワークショップ2010 （愛知） ,
2010年01月,ポスター発表
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フルオロカーボンハイドレートの熱力学的安定性
竹内史人, 大村亮, 泰岡顕治
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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ナノ構造固体表面での水滴の濡れ性
古石貴裕, 泰岡顕治, X. C. Zeng, 藤川茂紀, 戒崎俊一
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,口頭発表（一般）
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CUDAを用いた分子間相互作用計算高速化ライブラリの評価および気液界面物性の計算
坂牧隆司, 成見哲, 泰岡顕治
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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Lennard-Jones 系における分子動力学法と粗子化粒子動力学法の比較
荒井規允, 金城友之, 泰岡顕治, 兵頭志明
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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Isobaric-Multithermal アンサンブルによるスリット細孔に閉じ込められた Lennard-Jones 粒子の固液相転移の解明
金子敏宏, 美馬俊喜, 光武亜代理, 泰岡顕治
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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分子動力学的手法を用いた電解質水溶液中における水と脂質2重膜に関する研究
香川璃奈, 平野秀典, 泰岡顕治, 安井正人
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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細胞膜におけるキセノン麻酔の圧拮抗に関する分子動力学計算
清水寛之, 平野秀典, 成見哲, 泰岡顕治, 安井正人
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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拡張アンサンブル法を用いた両親媒性ペプチド分子の構造解析
原知之, 光武亜代理, 成見哲, 泰岡顕治
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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水バルクおよび気液界面系におけるIPS法およびWolf法のカットオフ依存性
高橋和義, 成見哲, 泰岡顕治
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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分子動力学的手法を用いたアクアポリンに関する研究
平野秀典, 沖本憲明, 泰岡顕治, 末松誠, 安井正人
第23回分子シミュレーション討論会 （名古屋） ,
2009年11月,ポスター発表
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気泡核生成現象における核生成速度の計算方法の比較
都築孝明, 泰岡顕治
第30回日本熱物性シンポジウム （米沢） ,
2009年10月,口頭発表（一般）
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分子動力学シミュレーションにおけるParticle Mesh Ewald法のGPUへの実装と評価
坂牧隆司, 成見哲, 泰岡顕治
第22回計算力学講演会 （金沢） ,
2009年10月,口頭発表（一般）
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分子動力学法によるナノスケール細孔に閉じ込められた単純液体の凝固と融解の解明
金子敏宏, 美馬俊喜, 泰岡顕治
第30回日本熱物性シンポジウム （米沢） ,
2009年10月,口頭発表（一般）
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Fast Multipole Methods on GPUs for the Meshfree Simulation of Turbulence
Rio Yokota, Tetsu Narumi, Ryuji Sakamaki, Kenji Yasuoka, Shinnosuke Obi
10th US National Congress on Computational Mechanics （Ohio, USA） ,
2009年07月,口頭発表（一般）
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ナノスケールスリットに閉じ込められた Lennard-Jones 粒子の固液相転移と結晶構造
金子敏宏, 美馬俊喜, 泰岡顕治
The 3rd Mini-Simposium on Liquids （岡山） ,
2009年06月,ポスター発表
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Isotropic Periodic Sum法およびWolf法を用いたMDシミュレーション
高橋和義, 成見哲, 泰岡顕治
第46回日本伝熱シンポジウム （京都） ,
2009年06月,口頭発表（一般）
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水/メタン気液界面の分子動力学シミュレーション
坂牧隆司, 成見哲, 大村亮, 泰岡顕治
第46回日本伝熱シンポジウム （京都） ,
2009年06月,口頭発表（一般）
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Calculation of Thermodynamics Properties on Methane / Water Interface Using fast Molecular Dynamics Simulation
Ryuji Sakamaki, Ryo Ohmura, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
The 3rd Mini-Symposium on Liquids （岡山） ,
2009年06月,ポスター発表
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分子動力学シミュレーションのGPUによる高速化
成見哲, 坂牧隆司, 泰岡顕治
第14回計算工学講演会 （東京） ,
2009年05月,口頭発表（一般）
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High-PerfoOCrmance Quasi Double-Precision Method using Single-Precision Hardware for Molecular Dynamics Simulations with GPUs
Tetsu Narumi, Tsuyoshi Hamada, Keigo Nitadori, Ryuji Sakamaki, Shun Kameoka, Kenji Yasuoka
HPC Asia 2009 （Kaohsiung, Taiwan） ,
2009年03月,口頭発表（一般）
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Client-Server Architecture for Accelerating Molecular Dynamics Simulations with a PLAYSTATION 3 Cluster
Shun Kameoka, Tetsu Narumi, Kenji Yasuoka
HPC Asia 2009 （Kaohsiung, Taiwan） ,
2009年03月,ポスター発表
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グラフィックカードを用いた水表面張力の高速分子動力学シミュレーション
坂牧隆司, 成見哲, 泰岡顕治
HPCS2009 （東京） ,
2009年01月,口頭発表（一般）
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Accelerating Molecular Dynamics Simulations by Special-Purpose Computers and Game Consoles
Tetsu Narumi, Toshikazu Ebisuzaki, Makoto Taiji, and Kenji Yasuoka
CALCON2007 (62nd Calorimetry Conference) （Hawaii, USA） ,
2007年08月,口頭発表（招待・特別）
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Learning Computer Simulation with an MDGRAPE Accelerator Card
Tetsu Narumi, Fumikazu Konishi, Ryo Umetsu, Makoto Taiji, Toshikazu Ebisuzaki, and Kenji Yasuoka
GHOU2007 (Global Hands-On Universe Conference) （Tokyo, Japan） ,
2007年07月,口頭発表（一般）
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散逸粒子動力学法による両親媒性分子の歪みによる球状‐ひも状ミセル転移の解析
松尾 亜児，荒井 規充，小沢 拓，島田 智子，泰岡 顕治，堀田 篤
第56回高分子学会年次大会 （京都） ,
2007年05月,口頭発表（一般）
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Acceleration of vortex methods calculation using a special-purpose computer and FMM
Tarun Kumar Sheel, Kenji Yasuoka, and Shinnosuke Obi
ICCM2007 (International Conference on Computational Methods 2007) （Hiroshima, Japan） ,
2007年04月,口頭発表（一般）
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散逸粒子動力学シミュレーションによる紐状ミセル水溶液のダイナミクスの解明
荒井規允，泰岡顕治，増渕雄一
第56回理論応用力学講演会 （東京） ,
2007年03月,口頭発表（一般）
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超新星コアにおけるパスタ相の存在量とその影響
園田英貴，渡辺元太郎，佐藤勝彦，滝脇知也，泰岡顕治，戎崎俊一
日本物理学会2007年春期大会 （東京） ,
2007年03月,口頭発表（一般）
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水滴に対する表面構造の疎水効果の分子動力学シミュレーション
古石貴裕，泰岡顕治，X.C.Zeng，戎崎俊一，藤川茂紀
日本物理学会2007年春期大会 （鹿児島） ,
2007年03月,口頭発表（一般）
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縦平均・横平均による巨視的な電場エネルギーの表式の分子動力学的検討
安藤史顕，藤谷洋平，泰岡顕治
日本物理学会2007年春期大会 （鹿児島） ,
2007年03月,口頭発表（一般）
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分子動力学法を用いたレナードジョーンズ流体による気泡核生成現象のシミュレーション
関根希仁，泰岡顕冶，金城友之，松本充弘
第56回理論応用力学講演会 （東京） ,
2007年03月,口頭発表（一般）
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分子動力学シミュレーションにおけるIPS法とCutoff法による動的性質の比較
高橋和義，泰岡顕治，成見哲
第56回理論応用力学講演会 （東京） ,
2007年03月,口頭発表（一般）