研究発表 - 舟橋 啓
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腫瘍内不均一性を考慮した予後の予測に向けた深層学習ベースの組織画像解析
舟橋 啓
群馬大学数理データ科学教育研究センター主催第1回レギュラトリー サイエンスセミナー （群馬県） ,
2019年09月,口頭発表（招待・特別）
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機械学習による画像分類
舟橋 啓, 徳岡 雄大
AIによる生物画像解析トレーニングコース （熊本県） ,
2019年08月,口頭発表（招待・特別）
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Inference of transcriptional regulatory network driven by desiccation and rehydration in Polypedilum vanderplanki
比企 佑介, 山田 貴大, Kozlova, O., Cornette, R., Gusev, O., 黄川田 隆洋, 舟橋 啓
Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2019 （Moscow, Russia） ,
2019年07月,口頭発表（招待・特別）
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Mathematical Modeling with CellDesigner.
FUNAHASHI Akira
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （沖縄県） ,
2019年07月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A modeling tool for biochemical networks
舟橋 啓
COMBINE 2019 （Heidelberg, Germany） ,
2019年07月,口頭発表（招待・特別）
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畳み込みニューラルネットワークを用いた神経分化判別および特徴量解析
舟橋 啓
山口大学 AIシステム医学医療研究教育センター セミナー （山口県） ,
2019年05月,口頭発表（招待・特別）
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不妊治療に資する深層学習を用いた初期胚定量評価手法の開発
舟橋 啓
Cardiovascular Meeting （東京都） ,
2019年05月,口頭発表（招待・特別）
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不妊治療に資する深層学習を用いた初期胚定量評価手法の開発
徳岡 雄大, 山田 貴大, 広井 賀子, 小林 徹也, 山縣 一夫, 舟橋 啓
第18回日本再生医療学会総会 （兵庫県） ,
2019年03月,口頭発表（招待・特別）
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Convolutional Neural Network-Based Instance Segmentation Algorithm to Acquire Quantitative Criteria of Early Mouse Development
舟橋 啓
Seminar at University of Nottingham （Nottingham, UK） ,
2019年03月,口頭発表（招待・特別）
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深層学習が駆動するPv11生存細胞スクリーニング
徳岡 雄大, 山田 貴大, Richard Cornette, 広井 賀子, 黄川田 隆洋, 舟橋 啓
エンジニアリングネットワーク・ワークショップ - 生物のもつ耐性機能と工学の融合 - （東京都） ,
2019年02月,口頭発表（招待・特別）
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深層学習が明らかにする細胞顕微鏡画像解析の新展開
舟橋 啓
山口大学 AIシステム医学医療研究教育センター セミナー （山口県） ,
2018年12月,口頭発表（招待・特別）
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Quantitative analysis of sensitivity to Wnt3a gradient in determination of the pole-to-pole axis of mitotic cells by using a microfluidic device.
平岩 巧, 山田 貴大, 三木 則尚, 舟橋 啓, and 広井 賀子
Keio University International Symposium on Advanced Technologies for Mechano-biology and Regenerative Medicine （Yokohama, Japan） ,
2018年09月,口頭発表（招待・特別）
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ディープラーニングを用いたマウス発生過程における定量的指標の獲得
舟橋 啓
第36回 日本受精着床学会総会・学術講演会 （千葉県） ,
2018年07月,口頭発表（招待・特別）
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深層学習が明らかにする細胞顕微鏡画像解析の新展開
舟橋 啓
関西医科大学大学院セミナー （大阪府） ,
2018年07月,口頭発表（招待・特別）
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Mathematical Modeling with CellDesigner.
FUNAHASHI Akira
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （沖縄県） ,
2018年06月,口頭発表（招待・特別）
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深層学習が明らかにする細胞顕微鏡画像解析の新展開
舟橋 啓
自然科学研究機構 新分野創成センター合同シンポジウム 「分野横断・分野融合研究による生命創成を探究する新しい科学の創成」 （愛知県） ,
2018年03月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner
舟橋 啓
SYSBIO 2018 Advanced Lecture Course on Systems Biology （Innsbruck, Austria） ,
2018年03月,口頭発表（招待・特別）
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Segmenting Four-dimensional Fluorescence Microscopic Image using Convolutional Neural Network
舟橋 啓
OIST Integrated Open Systems Unit Seminar （Okinawa, Japan） ,
2017年12月,口頭発表（招待・特別）
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Segmenting four-dimensional fluorescence microscopic image using Convolutional Neural Network.
舟橋 啓
Life of Genomes 2017 （Kazan, Russia） ,
2017年09月,口頭発表（招待・特別）
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The foundation of Biothermology from the point of view of nano/microscale thermophysical properties of biopolymers.
広井 賀子, 中村 隆之, 齋藤 昂哉, and 舟橋 啓
EMN Europe Meetings, on Quantum （Vienna, Austria） ,
2017年06月,口頭発表（招待・特別）
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Mathematical Modeling with CellDesigner.
FUNAHASHI Akira
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （沖縄県） ,
2016年08月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A process diagram editor for gene-regulatory and biochemical networks
FUNAHASHI Akira
Advanced Lecture Course on Systems Biology （Innsbruck, Austria） ,
2016年02月,口頭発表（招待・特別）
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Mathematical Modeling with CellDesigner.
FUNAHASHI Akira
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （沖縄県） ,
2015年08月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesignerによる生化学ネットワークのシミュレーション
舟橋 啓
第88回日本薬理学会年会・薬理学研究を加速させる数理モデル構築・シミュレーションソフトウェア、名古屋国際会議場 （愛知県） ,
2015年03月,口頭発表（招待・特別）
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Cells in Computers
FUNAHASHI Akira
Japanese-American Frontiers of Science Symposium (JAFoS) （Tokyo, Japan） ,
2014年12月,口頭発表（招待・特別）
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Computational Platform for Systems Biology
FUNAHASHI Akira
Multiscale Spatial Computational Systems Biology, Dagstuhl Seminar （Wadern, Germany） ,
2014年11月,口頭発表（招待・特別）
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Development of Nuclei Identification System from Fluorescent 4D Embryonic Images
Ozeki, M., Hori, M., Hiroi, N., Bashar, M. K., Yamagata, K., Kobayashi, T. J., and FUNAHASHI Akira
International Workshop on Quantitative Biology 2014 （Melbourne, Australia） ,
2014年09月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A process diagram editor for gene-regulatory and biochemical networks
FUNAHASHI Akira
Advanced Lecture Course on Systems Biology, （Innsbruck, Austria） ,
2014年03月,口頭発表（招待・特別）
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Introduction of Mathematical Modeling.
FUNAHASHI Akira and Hiroi, N.
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （沖縄県） ,
2013年08月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A process diagram editor for gene-regulatory and biochemical networks
FUNAHASHI Akira and Hiroi, N.
Computational and Mathematical Biology Course, Okinawa Institute of Science and Technology （Okinawa, Japan） ,
2013年08月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4.3: A Modeling Tool for Biochemical Networks.
FUNAHASHI Akira
The 2nd HD Physiology International Symposium: Integrative Multi-level Systems Biology for In Silico Cardiology and Pharmacokinetics, Marunouchi My Plaza Hall （Tokyo, Japan） ,
2013年06月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A process diagram editor for gene-regulatory and biochemical networks.
FUNAHASHI Akira and Hiroi, N.
CellDesigner Workshop, Monash University （Melbourne, Australia） ,
2013年05月,口頭発表（招待・特別）
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SBGN support in CellDesigner.
FUNAHASHI Akira
9th SBGN workshop （Edinburg, UK） ,
2013年04月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner: A Modeling Tool for Biochemical Networks.
舟橋 啓
CiRA Open Seminar Series、京都大学iPS細胞研究所 （京都府） ,
2012年12月,口頭発表（招待・特別）
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定量生物に効く数値計算
舟橋 啓
定量生物学の会第5回年会・チュートリアル （東京都） ,
2012年11月,口頭発表（招待・特別）
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バイオイメージの高速画像処理
舟橋 啓
画像科学夏の勉強会、核融合研究所 （岐阜県） ,
2012年09月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner plugin
FUNAHASHI Akira
Garuda 7 workshop （Okinawa, Japan） ,
2012年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4.2: A Modeling Tool for Biochemical Networks.
FUNAHASHI Akira
The 1st HD Physiology International Symposium: Integrative Multi-level Systems Biology for In Silico Cardiology and Pharmacokinetics, The University of Tokyo （Tokyo, Japan） ,
2012年01月,口頭発表（招待・特別）
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定量生物に効く数値計算
舟橋 啓
定量生物学の会第4回年会・チュートリアル （愛知県） ,
2012年01月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4.2: A Modeling Tool for Biochemical Networks.
FUNAHASHI Akira
The 4th Global COE International Symposium on Physiome and Systems Biology for Integrated Life Sciences and Predictive Medicine （Osaka, Japan） ,
2011年11月,口頭発表（招待・特別）
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An interactive equation-based biological model builder
FUNAHASHI Akira
Garuda 6 workshop （Okinawa, Japan） ,
2011年09月,口頭発表（招待・特別）
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Implementation of GPU accelerated ODE solver
FUNAHASHI Akira
Center for Bioinformatics, University of Tuebingen （Tuebingen, Germany） ,
2011年09月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner4.1: A process diagram editor for gene-regulatory and biochemical networks.
FUNAHASHI Akira
4th FEBS and 1st Systems X Advanced Lecture Course on Systems Biology （Innsbruck, Austria） ,
2011年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner plugin
FUNAHASHI Akira
Garuda 4 workshop （Okinawa, Japan） ,
2011年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner
FUNAHASHI Akira
Garuda 4 workshop （Okinawa, Japan） ,
2011年02月,口頭発表（招待・特別）
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GPGPUを用いたバイオイメージの高速画像処理
舟橋 啓
バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ、理研 （神奈川県） ,
2011年01月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner
FUNAHASHI Akira
Garuda One workshop （Okinawa, Japan） ,
2010年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner plugin
FUNAHASHI Akira
Garuda One workshop （Okinawa, Japan） ,
2010年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner plugin
舟橋 啓
Winter School on Computational Modeling in Biology （Okinawa Institute of Science and Technology） ,
2010年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner
舟橋 啓
Winter School on Computational Modeling in Biology （Okinawa Institute of Science and Technology） ,
2010年02月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner
FUNAHASHI Akira
Winter School on Computational Modeling in Biology （Okinawa, Japan） ,
2009年12月,口頭発表（招待・特別）
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生化学ネットワーク解析環境 CellDesignerの設計と実装
舟橋 啓
第 24 回生体・生理工学シンポジウム、東北大学 （宮城県） ,
2009年09月,口頭発表（招待・特別）
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生化学ネットワークエディタ CellDesignerの使い方
舟橋 啓
日本バイオインフォマティクス学会・夏の学校、静岡 （静岡県） ,
2009年09月,口頭発表（招待・特別）
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生化学ネットワーク解析環境CellDesignerの設計と実装
舟橋 啓
第24回生体・生理工学シンポジウム （東北大学） ,
2009年09月,口頭発表（招待・特別）, 日本計測自動学会
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Integration of CellDesigner and SABIO-RK
FUNAHASHI Akira
SABIO-RK User Meeting （Heidelberg, Germany） ,
2009年06月,口頭発表（招待・特別）
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Integration of CellDesigner and SABIO-RK
舟橋 啓
SABIO-RK User Meeting （Heidelberg, Germany） ,
2009年06月,口頭発表（招待・特別）
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システムバイオロジーの最前線: 定量生物学から計算生物学まで
小林 徹也, and 舟橋 啓
農学生命情報科学特論II、東京大学大学院農学生命科学研究科 （東京都） ,
2008年10月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4.0beta
FUNAHASHI Akira
Super-hackathon: Standards and Ontologies for Systems Biology 2008 （Okinawa, Japan） ,
2008年01月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4.0beta
舟橋 啓
Super-hackathon: Standards and Ontologies for Systems Biology （Okinawa Institute of Science and Technology） ,
2008年01月,口頭発表（招待・特別）
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An integration of CellDesigner and SABIO-RK
FUNAHASHI Akira, Matsuoka, Y., Jouraku, A., Kikuchi, N., and Kitano, H.
Storage and Annotation of Reaction Kinetics Data （Heidelberg, Germany） ,
2007年05月,口頭発表（招待・特別）
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An integration of CellDesigner and SABIO-RK
舟橋 啓
Storage and Annotation of Reaction Kinetics Data （Heidelberg, Germany） ,
2007年05月,口頭発表（招待・特別）
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CellDesigner 4, towards CellDesigner 5
FUNAHASHI Akira
Second BioModels.net training camp （Manchester, UK） ,
2007年01月,口頭発表（招待・特別）
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CellDeisgner 4, towards CellDesigner 5
舟橋 啓
Second BioModels.net training camp （Manchester, UK） ,
2007年01月,口頭発表（招待・特別）
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簡単プログラミングでコンピュータを従える
舟橋 啓
UNIX講座、東北公益文科大学 （山形県） ,
2005年02月,口頭発表（招待・特別）
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テキスト主義宣言
舟橋 啓
UNIX講座、東北公益文科大学 （山形県） ,
2004年02月,口頭発表（招待・特別）
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ソフトウェアの統合と標準化の基盤, SBMLとSBW
舟橋 啓
第1回バイオインフォマティクスセミナー、富士総合研究所 （東京都） ,
2003年12月,口頭発表（招待・特別）
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コンピュータの公益性
舟橋 啓
現代社会進化論、東北公益文科大学 （山形県） ,
2003年02月,口頭発表（招待・特別）